[3]​ Los Bolaños han sido una de las familias influyentes en la nación centroamericana ligadas al histórico Partido Liberal, dividido entre los partidarios del somocismo.

No obstante, Bolaños fue aventajado por dos personalidad de la UNO ideológicamente más moderadas, Virgilio Godoy Reyes, del Partido Liberal Independiente, y Violeta Barrios de Chamorro, dueña del diario La Prensa y durante años cabeza visible de la contestación a los sandinistas desde la legalidad institucional.

[3]​ Bajo el liderazgo de Arnoldo Alemán, el PLC planteó serias objeciones a la gestión de Chamorro, considerada condescendiente con los sandinistas, y en 1993 terminó por abandonar la UNO y colocarse en la oposición a la presidenta.

Bolaños precisó que las prioridades de la nueva administración iban a ser una gestión honesta de la cosa pública y la lucha contra la corrupción, la búsqueda de soluciones legales respecto a las tierras confiscadas en el período sandinista, y el desarme general del norte del país.

[1]​[3]​[5]​ Bolaños Geyer fue Miembro Honorario de la Fundación Internacional Raoul Wallenberg.

[cita requerida] En el Gobierno de Alemán, Bolaños mantuvo un perfil discreto, tanto por las limitadas atribuciones del puesto como por su personalidad.

Alejado de la primera línea, se proyectó ante la opinión pública como un dignatario apegado a las reglas del Estado de Derecho y el juego democrático, así como un hombre honesto, virtud esta que cobró relieve a medida que otros miembros del ejecutivo, con Alemán a la cabeza, eran acusados de corrupción.

Aunque considerado un servidor público recto y competente, Bolaños distaba mucho de ser un político carismático, y muchos consideraban que su actuación como vicepresidente había sido, cuando menos, tímida.

Bolaños se impuso con un contundente 56,3% de los votos sobre Ortega, receptor del 42,3 %.

[5]​ Sin embargo, los alemanistas se apuntaron su primera victoria en la víspera misma del traspaso de la banda presidencial cuando 49 diputados eligieron a Óscar Moncada como presidente de la Asamblea Nacional frente al postulante propuesto por Bolaños, Jaime Cuadra Somarriba.

[5]​ Los ministros del gobierno de Enrique Bolaños que permanecieron durante todo su mandato fueron: Norman Caldera (Relaciones Exteriores), Julio Vega (Gobernación), Margarita Gurdián (Salud), Avil Ramírez (Defensa), Mario Salvo (Agricultura) y Ramón Lacayo (Inversiones y Economía).