[2] A la par de la primera vuelta se realizaron las elecciones legislativas en que se eligieron a los representantes al Parlamento Andino y los Asambleístas para el mismo período,[3] además de una consulta popular sobre la opinión del electorado sobre la cuestión de los funcionarios públicos que tengan cuentas y empresas en paraísos fiscales.
[13] Por parte del movimiento oficialista Alianza PAIS, se empezaron a barajar posibles precandidatos presidenciales, nombrando el presidente Correa al ministro del interior José Serrano, a la presidenta de la Asamblea Nacional Gabriela Rivadeneira, al exvicepresidente Lenin Moreno y al vicepresidente Jorge Glas, siendo los dos últimos los más nombrados para recibir la candidatura, aumentando ambos su presencia pública ante esto.
[14] A mediados del 2016, un grupo independiente denominado Rafael Contigo Siempre, presentó una propuesta de Referéndum Constitucional, en la cual se somete a votación la vigencia o no de la transitoria sobre la reelección aprobada por la Asamblea, teniendo como objetivo permitir una candidatura a la reelección del presidente Correa, siendo esta propuesta aprobada por la Corte Constitucional, permitiendo que inicien el proceso de recolección de firmas, necesitando 950 000 firmas aproximadamente para que se llame a elecciones.
En agosto, el colectivo presentó 1 248 000 firmas al Consejo Nacional Electoral para su revisión.
[15][16] Alianza PAIS se desmarcó de esta propuesta; el presidente Correa anunció reiteradamente que no planea candidatearse aunque se apruebe el referéndum; mientras que la oposición criticó fuertemente esta propuesta.
Se desarrolló un nuevo modelo de biombo para asegurar que el voto sea secreto.
[57] Previamente se habían enviado 830 paquetes electorales a las circunscripciones del extranjero.
Para la segunda vuelta, el Consejo Nacional Electoral, basándose en las recomendaciones entregadas por las diferentes entidades internacionales invitadas como observadores de la primera vuelta electoral, decidió volver a utilizar urnas tradicionales para facilitar el conteo y evitar confusiones por parte de la ciudadanía al introducir las papeletas en los orificios.
[cita requerida] El 23 de agosto de 2016, la vicepresidenta del Consejo Nacional Electoral, Nubia Villacís, indicó que no era válido realizar proselitismo político de ninguna índole en medios tradicionales fuera del período establecido para la campaña electoral oficial, pero que no se regularía nada en redes sociales.
[66] Henry Llanes, asambleísta alterno del Movimiento CREO, denunció que Alianza PAIS utilizó recursos públicos durante la postulación del binomio presidencial oficialista al ser transmitido por los canales de televisión públicos y por los canales privados incautados, presentando una denuncia al CNE, el cual fue transferido al Tribunal Contencioso Electoral, organismo rechazó la denuncia.
Desde septiembre de 2016, Moreno empezó a realizar apariciones virtuales en mítines y reuniones con organizaciones políticas vía videoconferencia, ya que por su rol como Enviado Especial de las Naciones Unidas residía en Ginebra, Suiza.
Moreno propuso establecer diálogo con todas las organizaciones políticas y continuar con la labor del gobierno de Correa, rechazando eliminar impuestos, sino entablar una "tregua normativa".
[79] Al final de su campaña, Moreno propuso el plan "Toda una Vida", en la cual ofrece viviendas gratis para los más pobres del país, el aumento del bono solidario a 150 dólares mensuales, la Misión Ternura que consiste en que el estado garantice la salud de los niños recién nacidos y sus madres y la Misión Mis Mejores Años consistiendo en aumentar el bono al adulto mayor a 100 dólares mensuales.
enfocándose en proponer un cambio verdadero para el país y la unidad de los ecuatorianos.
Durante la segunda vuelta, su campaña se enfocó en promover sus propuestas en los ámbitos de salud y educación, realizando campaña principalmente en las provincias de la Costa y Pichincha, además de intentar contrarrestar la que denominó Lasso como "campaña sucia" del candidato oficialista, siendo agredido junto a su familia en los exteriores del Estadio Olímpico Atahualpa en Quito luego del partido Ecuador vs.
Se enfocó en mantener reuniones con organizaciones sociales próximas a su coalición política, como son la CONAIE y la Ecuarunari, además de mantener reuniones con diferentes cámaras de comercio para promover su proyecto económico.
[111] Bucaram mantuvo una campaña enérgica, bailando frecuentemente en las caravanas y mítines, siendo sus spots políticos musicales, utilizando fuertemente las redes sociales.
[113] Fue uno de los candidatos con menos presencia mediática, realizando principalmente entrevistas a radios locales y visitando las diferentes ciudades del país.
Sus cuñas se enfocaron en introducirse y diferenciarse de los demás candidatos presidenciales.
Zuquilanda reconoció que su nombre surgió a última hora ante la necesidad del partido de presentar un binomio presidencial para mantener su registro y para apoyar la candidatura de Gutiérrez a la Asamblea Nacional.
Enfocó su campaña en presentarse como alguien fuera de la estructura política actual sino como una Tercera Vía política,[120] proponiendo una auditoría de la deuda externa e interna, instaurar un proyecto de unidad nacional entre el sector público y privado para mejorar la economía y el empleo, indicando que para realizar esto propondrá múltiples leyes y reformas legales a través de una Asamblea Constituyente, prometiendo independizar al poder judicial, siendo su experiencia como fiscal general y abogado de carrera lo que autoriza a realizar estas propuestas.
Posterior al proceso electoral del domingo 19 de febrero se dieron reclamos por parte de varios ciudadanos, miembros de organizaciones políticas y seguidores de los movimientos contrarios al oficialismo, por supuestos actos irregulares durante el proceso de votación y escrutinio; con ello surgieron manifestaciones lideradas principalmente por simpatizantes y miembros del movimiento CREO ante el edificio sede del Consejo Nacional Electoral en Quito,[122] en Guayaquil[123] y en varias delegaciones electorales de otras ciudades del país, en donde les exigían al CNE dar a conocer resultados del proceso electoral y declarar la segunda vuelta ante un presunto fraude electoral que beneficiaría al oficialismo.
[124] El exministro del interior y candidato a asambleísta nacional José Serrano Salgado de Alianza PAIS, presentó una denuncia formal en el CNE por posible fraude electoral dado por inconsistencias en un importante número de actas provenientes principalmente del exterior, afectando supuestamente al movimiento oficialista.
[126] Horas más tarde al revelarse los resultados oficiales de conteo rápido del CNE (correspondientes a la Escuela Politécnica Nacional) por medio de una cadena nacional se conoció que el ganador era Lenín Moreno, lo que llevó a Guillermo Lasso a rechazar los resultados ya que no coincidían con la encuestadora CEDATOS y acusó al CNE de fraude por la caída del sitio web.
[129] Luego Lasso anunció que presentaría impugnaciones, también llamó a una vigilia por la democracia con movilizaciones pacíficas.
[131] Ante la presión por supuestas amenazas de muerte a sus miembros la ONG reveló los resultados en donde se indicó que el estudio dio un 49,2% de votos para Guillermo Lasso y un 50,8% para Lenín Moreno.
[136] Ante ello el presidente del CNE, Juan Pablo Pozo, anunció que se aceptará el pedido de recuento de votos si las pruebas del movimiento CREO tienen sustento.
[144][145][146] Asimismo constó con el soporte del Instituto Geográfico Militar para verificar la autenticidad de las actas y papeletas sometidas al proceso.
Lenín Moreno por su parte decayó al 36% y Lasso obtuvo alrededor 19%, según la encuestadora Informe Confidencial.
Les continuaban en su respectiva posición Moncayo, Bucaram, Espinel, Zuquilanda y Pesántez.