Fue el desarrollo final del anterior tipo de transporte civil Dornier Komet; la aerolínea Deutsche Luft Hansa fue la compañía que utilizó el mayor número de estos aviones, incluyendo algunos Komet III convertidos.

De hecho, la planta motriz determinó la diferencia entre las versiones Merkur I y Merkur II, ya que el primero estaba propulsado con un BMW IV sin reductor mientras que el segundo llevaba un BMW VI de 612 hp (456 kW) con reductor .

También, Mittelholzer con el Merkur Do B-Is CH-171 Switzerland especialmente equipado realizó una expedición africana; el fuselaje fue convertido en un salón dormitorio para una tripulación de cuatro hombres, así como un cuarto oscuro.

En 1928, Kawasaki importó un Dornier Merkur de Alemania, que se utilizó por el Servicio Aéreo del Ejército Imperial Japonés.

2 (あ い こ く 2 en japonés) visible en el costado del fuselaje; finalmente fue destruido durante de la Invasión rusa en Manchuria en 1945.