Al contrario que muchas familias gaélicas, estos MacCarthys prosperaron en el estado protestante inglés de Irlanda a comienzos del siglo XVII.Sin embargo, se le llamó para unirse a la rebelión debido a las atrocidades cometidas por William St Leger, gobernador inglés en Munster, contra la población católica en general.Ormonde era cuñado de Muskerry y Muskerry simpatizaba más con la causa realista que con los confederados más intransigentes representados por Giovanni Battista Rinuccini y Owen Roe O'Neill.Sin embargo, Irlanda fue invadida rápidamente por el New Model Army Parlamentarista de Oliver Cromwell en 1649, que pretendía vengar el levantamiento de 1641, confiscar suficientes tierras como para pagar a los acreedores del parlamento y eliminar un peligroso baluarte del realismo.Sus hijos Charles y Justin MacCarthy, Vizconde Mountcashel sirvieron en las fuerzas inglesas durante la segunda guerra anglo holandesa y la guerra guillermita de Irlanda respectivamente.
