La División de Honor femenina de balonmano 1998-1999 fue la cuadragésimo segunda edición de la División de Honor Española.
Se proclamó campeón el ALSA Elda Prestigio.
[1] De primera división subieron el C.H.
Maritim, el Mediocentro Gijón y el Famadesa Costa del Sol.
En la promoción por la permanencia, el 5.º y el 6.º clasificado del grupo por la permanencia, el Caja Cantabria Clubasa y el Verdaloe Santander se enfrentaban al Esportiu Castelldefels y al Famadesa Costa del Sol, del que tan solo subió el equipo malagueño.