En 1985 desapareció dando origen a la Dirección General de Investigación y Seguridad Nacional, que en 1989 se convirtió en el Centro de Investigación y Seguridad Nacional (CISEN), y al Centro Nacional de Inteligencia (CNI) en 2018.

[cita requerida] En 1942, y dado que México entró a la Segunda Guerra Mundial declarando la guerra a las potencias del eje, se ampliaron las funciones de esta oficina, siendo ahora encargada de dar seguimiento a los sucesos del conflicto bélico y cambiando su nombre a "Departamento de Investigación Política y Social".

En 1947, durante el gobierno de Miguel Alemán Valdés, y dada la aparición de grupos subversivos en el país, el DIPS desapareció y en su lugar fue fundada la Dirección Federal de Seguridad a cargo del general Marcelino Iñurreta de la Fuente,[3]​ cuyas funciones además de realizar espionaje político, consistían ahora en sofocar a los grupos opositores al régimen y ubicar y detener a sus principales líderes.

Durante la guerra fría en México ocurrió un patrón de represión política y militar, al que se denomina guerra sucia, en el cual la DFS en conjunto con el ejército mexicano fue responsable de detenciones ilegales, desapariciones forzadas y allanamientos.

Aguayo Quezada asegura que Buendía había recibido un documento secreto que contenía información sobre nexos entre José Antonio Zorrilla Pérez, entonces director de la agencia, y el Cártel de Guadalajara.