La diócesis de San José del Guaviare (en latín: Dioecesis Sancti Iosephi a Guaviare) es una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Colombia.

Desde el 4 de octubre de 2024 es sede vacante y su administrador diocesano es el presbítero Edgar Liévano Labrador.

[2]​ La diócesis tiene 42 327 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en el departamento del Guaviare, compuesto por 4 municipios: Calamar, El Retorno, Miraflores y San José del Guaviare.

En 2022 en la diócesis existían 17 parroquias agrupadas en 2 zonas pastorales: Urbana y Rural.

Según el Anuario Pontificio 2023 la diócesis tenía a fines de 2022 un total de 102 240 fieles bautizados.