[3] Juega como defensor y su equipo es el Centro Recreativo Porongos Fútbol Club de Uruguay.Es recordado principalmente por su paso por el Atlético de Madrid,[4] club con el que llegó a disputar 389 partidos en 9 temporadas.[5] A la edad de 15 años se incorporó a la sexta división del club Defensor Sporting y luego pasó en el 2003 al Club Atlético Cerro, de la primera división del fútbol uruguayo.Debido a su gran desempeño en Cerro, fue fichado en el 2006 por el Club Nacional de Football.En el Villarreal compartió equipo con su compatriota Sebastián Viera, arquero que provino también del Club Nacional de Football.En la Copa del Rey, el 17 de mayo disputó la final frente al Real Madrid en el Estadio Santiago Bernabéu.Godín de nuevo fue titular y se proclamó campeón al vencer en la prórroga por dos goles a uno.Durante esos últimos dos meses, disputó cinco partidos como titular y anotó dos goles.Además, por segundo año consecutivo, la defensa del Atlético de Madrid fue la menos goleada y Thibaut Courtois el Premio Zamora.En la Liga de Campeones el equipo se clasificó para jugar la final por segunda vez en su historia.[19] Así, 5 días más tarde, en el encuentro liguero que enfrentaba al Atlético de Madrid contra el Sevilla F. C. (1-1), se le hizo un acto de despedida que se realizó al finalizar el encuentro.Además, el Frente Atlético realizó una pancarta con la frase «un gol para el recuerdo, un faraón para la historia», en referencia al gol que marcó el capitán rojiblanco en el Camp Nou que dio al Atlético de Madrid su décimo título liguero en la temporada 2013/14.El equipo le entregó una camiseta con su nombre y las firmas de todos los jugadores, y además la leyenda rojiblanca Luiz Pereira, le entregó en mano una placa conmemorativa en reconocimiento a las 9 temporadas que disputó con el conjunto madrileño.[24] Pocas horas después de haber quedado libre, Atlético Mineiro anunció su contratación por un año.Fue seleccionado para participar en la Copa América 2011, en la que se alzó con el título pese a sólo poder disputar los dos últimos minutos de la final debido a una lesión que se hizo antes del comienzo de la competición.Fue titular en todos los partidos salvo en el enfrentamiento ante la débil Tahití, ayudando con sus actuaciones a que su selección consiguiera el cuarto puesto.
Celebración del título de liga del
Atlético de Madrid
club de fútbol en la temporada 2013-2014.