[1]​ En 2023 en la diócesis existían 160 parroquias agrupadas en 9 vicariatos: Città di Pistoia, Quarrata, Poggio a Caiano-Carmignano, Montale-Agliana-Montemurlo, Ombrone Limentra, Bottegone, Vincio, Montalbano occidentale y Reno-e-Montagna.

Recientes descubrimientos arqueológicos permiten datar una cierta presencia cristiana en Pistoya en el bajo Imperio romano.

El primer documento histórico que habla de un obispo de Pistoya, aunque anónimo, es una carta del papa Gelasio I del 492/496, donde, junto a otros obispos, se le describe como aetate vel honore longaevus.

Algunos autores creen que entre Massimiliano, Geronzio, Terenzio y Vitale probablemente estaba también el obispo de Pistoya.

Giovanni es también el primer obispo de Pistoya cuyo nombre se conoce con certeza.

Según el historiador diocesano Sabatino Ferrali, los obispos citados en las cronologías locales para el siglo VIII son ficticios, insertados también para llenar el vacío entre Giovanni I y Guillerado.

Entre los siglos XII y XIII el territorio diocesano se organizó en parroquias y pieves, asumiendo la estructura que se mantuvo hasta las reformas de Scipione de' Ricci a finales del siglo XVIII.

El seminario diocesano fue erigido recién en 1693 con el obispo Leone Strozzi en el antiguo convento agustino de Tolentino, trasladado a la plaza San Leone en las primeras décadas del siglo XVIII y trasladado definitivamente a las instalaciones del antiguo convento franciscano de Santa Clara en 1783.

En este sínodo el obispo promovió reformas jansenistas en la liturgia, en la educación, en la disciplina del clero, en la doctrina y llegó hasta prohibir el culto al Sagrado Corazón de Jesús.

El Sínodo sumió a la diócesis en la confusión, hasta el punto de amenazar con un cisma en toda la Toscana.