Daniel Cifuentes se formó en las categorías inferiores del Real Madrid de la mano de entrenadores como Paco Buyo o Vicente del Bosque y coincidiendo con jugadores como Iker Casillas, Julio Álvarez, César Navas.
Su gran rendimiento acaparó la atención del técnico José Luis Mendilibar que se lo llevó al club insular UD Lanzarote.
En la SD Eibar realizan la mejor campaña hasta ese momento luchando por el ascenso a Primera División logrando un gran 4.º puesto.
El buen papel desarrollado en esa campaña le llevó a firmar por la Real Sociedad en la que militaría un año y medio, logrando su mejor partido frente al Atlético de Madrid.
Su papel en dicho club llamó la atención del equipo de Primera División Real Valladolid en el que estuvo hasta que en el mercado invernal de la campaña 2007-2008, fue llamado por Javi Gracia para ayudar a conseguir el ascenso del Cádiz CF, objetivo que consiguieron tras ganar al Real Unión Club en la fase de ascenso.