Gaizka nació en Derio cuando formaba parte de Bilbao, unión que se mantuvo hasta 1983.
En abril de 1994 Koldo Aguirre le hizo debutar en el Bilbao Athletic, que se encontraba en Segunda División.
Sin embargo, no tuvo mayor continuidad y jugó toda la temporada con el equipo filial en Segunda B.
Tras una temporada con poca participación, decidió marcharse al C. D. Ourense de Segunda B.
[10] En su debut en la Liga, el Eibar de Garitano completó la primera vuelta en una meritoria octava posición, con 27 puntos.
[12] No obstante, finalmente el Eibar se mantuvo en Primera División gracias al descenso administrativo del Elche.
[22] En la temporada 2018-19 dirigió al cuadro filial durante los primeros quince partidos, en los que sumó 22 puntos.
[30][31] El 27 de enero, tras derrotar por 1 a 0 al Real Betis, se convirtió en el tercer entrenador debutante del club sin derrotas en sus primeros siete partidos ligueros tras Fred Pentland y Ferdinand Daučík.
[35] Sin embargo, después de sufrir tres derrotas en las últimas seis jornadas, perdió el séptimo puesto en favor del R. C. D. Espanyol -igualados a 53 puntos- tras una derrota a domicilio ante el Sevilla en la última jornada.
El último entrenador que había llevado al club a liderar la clasificación, sin incluir la primera jornada, fue Jupp Heynckes en 1993.
[41] Bajo su dirección, el equipo vizcaíno terminó 3.º en la Liga regular, perdiendo el ascenso directo en la última jornada.
[43] En la temporada siguiente, el equipo guipuzcoano volvió a clasificarse para la promoción de ascenso, donde cayó ante el Deportivo Alavés.