En 1518 se unió a la corte del rey Manuel I de Portugal como paje (aunque Marcelino Menéndez Pelayo dice que ya estaba en la corte a los nueve años) hasta el fallecimiento del monarca en 1521.

[2]​ Su sucesor, Juan III, envió en 1523 a Góis / Goes a Amberes como secretario y tesorero de la feitoria (factoría, oficina comercial), un cargo muy lucrativo que le permitió costearse una colección de arte y ofrecer magníficos regalos.

En 1540 publicó su famosa obra Fides, religio, moresque Aethiopum, que describía detalles desconocidos del cristianismo ortodoxo etíope e incluía un apéndice sobre los sami, entonces llamados lapones.

[6]​ Este libro recibió una difusión amplia en Europa, tanto en círculos protestantes como católicos, y hubo ediciones sucesivas exitosas (París, 1541, Lovaina, 1544, Leiden, 1561, Colonia, 1574).

Sin embargo, este proceso, secreto como todos los de la Inquisición, no obró efectos entonces contra él.