La Copa El Salvador 2016-17[1]​[2]​ fue la primera edición de la Copa El Salvador, reemplazando a la Copa Presidente.

[3]​ El torneo es organizado por la Federación Salvadoreña de Fútbol y participaron clubes de la Primera, Segunda y Tercera División.

Se tenía previsto que se desarrollara junto a los torneos Apertura 2016 y Clausura 2017 disputados por las tres ligas,pero sufrió retrasos debido a problemas de organización.

[4]​ Santa Tecla se proclamó campeón por primera vez en su historia tras vencer a FAS en la final con marcador de 1 - 0.

La organización otorgó tres reconocimientos tras la finalización del torneo:[8]​