El campeonato está planificado para celebrarse durante los torneos de Apertura y Clausura de las tres divisiones profesionales correspondientes a una temporada regular (entre verano y verano boreales).

Como antecedente de este evento en El Salvador existió la Copa Presidente, un torneo que igualmente acogía a equipos de las tres divisiones profesionales pero que enfrentó dificultades de organización[3]​ y se celebró únicamente en tres oportunidades.

Los tres equipos de cada grupo se enfrentarán en un sistema de todos contra todos a visita recíproca según calendario definido por sorteo dando como resultado seis jornadas y cuatro partidos disputados por cada equipo durante esta fase.

Los 16 equipos clasificados serán emparejados mediante sorteo para dar inicio a una fase de eliminación directa con visita recíproca en la cual clasificarán los equipos que obtenga la victoria en el resultado global de su serie particular, siendo el único criterio de desempate los lanzamientos desde el punto penal.

Los últimos dos equipos de las series de eliminación directa se enfrentarán en una final a único partido en campo neutral convenido entre la Comisión Organizadora y los equipos participantes.