El campeonato está planificado para celebrarse durante los torneos de Apertura y Clausura de las tres divisiones profesionales correspondientes a una temporada regular (entre verano y verano boreales).

El presidente del Instituto Nacional de los Deportes de El Salvador (INDES), Yamil Bukele, ha revelado que regresa la Copa INDES (anteriormente conocida como Copa Presidente o Copa El Salvador) para este 2025, con una estructura renovada que incluirá equipos de la Primera, Segunda y Tercera División.

En una entrevista reciente en el programa El Gráfico TV, Bukele confirmó que el torneo será largo y abarcará varias divisiones del fútbol salvadoreño, lo que permitirá mayor inclusión y competencia entre equipos de diferentes categorías.

"Sí, será un torneo largo, que incluirá equipos de la Segunda, Tercera y Primera División", explicó Bukele.

Los tres equipos de cada grupo se enfrentarán en un sistema de todos contra todos a visita recíproca según calendario definido por sorteo dando como resultado seis jornadas y cuatro partidos disputados por cada equipo durante esta fase.