Estaba situada en la actual manzana formada por las calles de Arenal, Hileras, y San Martín.
A finales del siglo XVI fue concedido el permiso de abadía independiente.
La parroquia fue creciendo en volumen de población, de tal forma que a comienzos del siglo XVII el arrabal ya poseía unas cien calles y unas dos mil quinientas casas.
Ambas iglesias estaban regidas por monjes benedictinos que proporcionaban servicio religioso al monasterio.
La de San Marcos comenzó siendo una modesta ermita que fue planteada posteriormente por Ventura Rodríguez.