El tercer SNR coordinó la resistencia eslovaca contra los nazis y su gobierno títere eslovaco, y se convirtió en un órgano de poder estatal controlado por los comunistas después de la Segunda Guerra Mundial.

[1]​ Se formó una milicia en Viena y marchó hacia el oeste de Eslovaquia, donde la gente de las tierras checas, Moravia y Eslovaquia se unió a ella en un intento por fomentar un levantamiento.

[2]​ Los enfrentamientos militares continuaron durante el invierno y hasta 1849, pero los eslovacos fueron completamente derrotados en noviembre de ese mismo año.

[1]​ Tras la represión de los levantamientos en Hungría y Eslovaquia, el nuevo emperador austrohúngaro, Francisco José I, trató de cooptar a los tres líderes eslovacos ofreciéndoles puestos en la administración estatal.

Se negaron, insistiendo en sus demandas anteriores de un territorio eslovaco separado dentro del imperio.

El estallido de la Primera Guerra Mundial unos meses más tarde significó que permaneció inactivo durante los siguientes cuatro años, cuando los eslovacos lucharon por las Potencias Centrales como parte del Imperio Austro-Húngaro.

[7]​ El SNR emitió el llamado "Acuerdo de Navidad" que establecía un programa para restablecer Eslovaquia como parte de un estado checoslovaco reconstituido bajo un gobierno democrático,[1]​ postura que fue apoyada por todas las principales fuerzas antifascistas.

[1]​ Cuatro consejos nacionales eslovacos también se proclamaron en el extranjero en varias ocasiones entre 1920 y 1948.

Fue fundado en Roma, Italia, en mayo de 1948 después del golpe comunista en Checoslovaquia, con Karol Sidor, Konštantin Čulen, Jozef Kirschbaum y otros como miembros fundadores.