Posteriormente el nombre sería utilizado por otros Aliados de la Segunda Guerra Mundial, que también lo reconocieron.

Desde allí, en 1941 se mudó a Aston Abbots, Buckinghamshire, donde buscó resguardo frente al London Blitz.

Beneš inicialmente huyó hacia la Universidad de Chicago, donde se refugió en la misma comunidad que una vez había dado refugio a su predecesor y amigo, Tomáš Masaryk.

[3]​ Durante su estancia allí, se le pidió que regresara a Europa para organizar algún tipo de gobierno en el exilio.

De hecho fue Francia la que mayores obstáculos puso para aceptar al Comité como un gobierno en el exilio con plenos poderes.

Asimismo, aunque extendió el reconocimiento al Comité como una agencia no gubernamental, su gobierno se mantuvo neutral en cuanto a Beneš, y vio muchas posibilidades para una Checoslovaquia de posguerra.

[4]​ Sin embargo, dado que Beneš era clave para conseguir el apoyo militar del ejército checoslovaco, Francia se convirtió en la primera nación en firmar un tratado con el Comité.

Por ello, el Comité presionó a los británicos en abril de 1941, para que fueran más claros.

Sin embargo, la Unión Soviética se opuso a un compromiso de tres partes.

En marzo de 1945 otorgó puestos clave en su gabinete ministerial a exiliados checoslovacos comunistas en Moscú.