En 1899 por Ley de Presupuesto se independizaron del Colegio Nacional Central, todas las secciones existentes.

Según escritura N.º 232 del 28 de junio, el inmueble, tenía 3978 m² (metros cuadrados) y una ubicación muy conveniente (Av.

[4]​[5]​ El Colegio Nacional Mariano Moreno ha sido epicentro de importantes hechos políticos y sociales, como el debate sobre la ley laica y libre, que generó una profunda movilización durante el gobierno de Arturo Frondizi.

Durante la última dictadura cívico militar, el edificio del colegio pasó a albergar al Profesorado «Joaquín V. González», lo que provocó un descenso abrumador de la matrícula del Moreno, la construcción de aulas en lugares que formaban parte del patio para contener a los alumnos (entre ellos las famosas «aulas colectivo», también llamadas peceras) y fuertes reclamos por parte de alumnos, docentes y autoridades del colegio, que durante 30 años no fueron escuchadas.

Viviana Careaga Ingeniera electronica cantante directora del Centro Cultural Condorkanki