Compitió en categorías regionales hasta que en la temporada 1998-99 consiguió el ascenso a a Tercera División, categoría en la que militarían durante tres temporadas, descendiendo en 2002.
[3] En la temporada 2018-19 el equipo tras una mala planificación y una falta evidente de competitividad, quedó en 19.ª posición lo que supuso su descenso a Regional Preferente.
Tras un periplo de un año en Regional, el equipo ascendió como segundo clasificado a Tercera División.
En primer lugar fichó al entrenador Eduardo Hache, del River Ebro e incorporó a muchos jugadores jóvenes.
Este acuerdo de filialidad desencadenó el descenso del club a Regional Preferente, pese a haber consiguido la mejor clasificación de su historia, el tercer puesto en Tercera Federación.
Santiago fue uno de los fundadores del club y toda su vida estuvo ligada al equipo.
Tiene una sección de Fútbol Sala, creada en el año 2003, que milita en 3.ª División Nacional.