El equipo sénior vivió en los años 90 su mejor época llegando a jugar en la temporada 1997-98 en Primera División Nacional.

Además, esta fue la sección pionera del deporte femenino en el C. P. Calasancio.

La sección de fútbol fue creada en colaboración con el desaparecido C. D. Logroñés y ha formado jugadores de la talla de José Ignacio (C. D. Logroñés, Valencia C. F., Real Zaragoza o R. C. Celta de Vigo) o David López Moreno (C. At. Osasuna, Athletic Club o Brighton & Hove Albion F. C.).

En 2005 el club inscribió un equipo en Regional Preferente de La Rioja logrando el ascenso a Tercera División al dividirse el Grupo XV en dos subgrupos (uno para equipos navarros y otro para riojanos) y promocionarse hasta 7 equipos de la Preferente.

Existió una sección de atletismo durante dos temporadas formada mayoritariamente por chicas, que terminó por desaparecer debido a la falta de demanda.