En esta temporada se volvió al sistema de competición de dos grupos, divididos entre Rioja Alta y Rioja Baja.
Los 24 equipos se reparten en dos grupos, que se enfrentan a doble vuelta, una vez en casa y otra en el campo del equipo rival, todos contra todos.
Los cuatro primeros clasificados de cada grupo pasan a una fase de ascenso, en modo liguilla, enfrentándose también todos contra todos a doble vuelta.
El campeón de esta liguilla asciende a Tercera División.
El segundo clasificado se enfrentará en un playoff a ida y vuelta contra el segundo clasificado de la Preferente de Navarra.