Su única hija conocida es Berenice IV, aunque probablemente también fue la madre de Cleopatra VII.

268-269, 273) El historiador alemán de la Edad Antigua Werner Huß se refiere a ella como ‘Cleopatra VII Trifena’.

[10]​ Se menciona que en el año 88 a. C., Ptolomeo X huyó de Egipto con su esposa Berenice III y su hija.

Cleopatra Trifena podría ser esta hija de la que no se menciona su nombre.

[15]​ No está claro cuánto vivió Cleopatra V ni con que menciones a Cleopatra Trifena en el registro histórico debe ser identificada, ya que la numeración utilizada para distinguir a los Ptolomeos es una creación moderna.

Si realmente hubiera muerto tan pronto, entonces la Cleopatra Trifena que se menciona (tras la expulsión de Ptolomeo XII) como cogobernante de Egipto junto con Berenice IV en 58 y 57 a. C., y que falleció alrededor del año 57 a. C., debe de ser su hija, que ha sido numerada por algunos historiadores como Cleopatra VI Trifena, opción apoyada por el filósofo griego Porfirio.