[2]​ Cuando en 1571 se proyectó la construcción de la primera Iglesia de la Compañía, se construyeron dos capillas laterales a la misma.

Luego del terremoto de 1650 en el que dicho edificio tuvo que ser derrumbado, se dispuso la construcción de ambas capillas laterales, cada cual con su propia puerta hacia la plaza y otra que comunicaba con el templo principal[3]​.

Las obras estuvieron a cargo del fraile Juan Bautista Egidiano[4]​.

La Capilla de Nuestra Señora de Loreto se construyó en la esquina que hacía la plaza con la calle Intik'ijllu.

Fue consagrada a la Virgen de Loreto y tuvo ese nombre hasta 1894 cuando los obispos Pedro José Tordoya y Juan Antonio Falcón cambiaron su advocación a la Virgen de Lourdes[5]​.