Está situada al norte de las montañas del Harz.
En 1180/82 la ciudad fue destruida por Federico I Barbarroja porque la ciudad había jurado lealtad exclusiva a Enrique el León.
En 1625, durante la Guerra de los Treinta Años la ciudad fue sitiada y ocupada por Wallenstein.
En el siglo XVII se convirtió en residencia secundaria de los duques de Brunswick-Luneburgo, lo que fomentó su desarrollo.
En Blankenburg han nacido el filósofo Oswald Spengler y Premio Nobel de Física Polykarp Kusch.