Abogado de profesión, era un nacionalista que se oponía al mandato francés , y el 11 de noviembre de 1943, fue detenido por las tropas francesas instaladas en el Líbano, fue encarcelado en la Torre Rashaya durante once días, junto con Riad El-Solh (el primer ministro), Pierre Gemayel, Camille Chamoun y numerosas personalidades que iban a dominar la política del Líbano en la generación venidera, tras la independencia.

Khoury es recordado por su participación en la elaboración del Pacto Nacional, un acuerdo entre los cristianos del Líbano y los líderes musulmanes que constituye la base de la estructura constitucional del país.

En el Pacto, los cristianos aceptan la afiliación del Líbano con la Liga Árabe y acordaron no tratar la protección francesa en el Líbano, los musulmanes prestaron acuerdo en aceptar que el Estado libanés mantenga sus fronteras actuales y prometió no buscar la unificación con la vecina Siria.

En el Pacto también se distribuyeron los escaños en la Asamblea Nacional en una proporción de seis a cinco cristianos y musulmanes respectivamente, basado en el censo de 1932 (esto ha sido modificado para representar a los seguidores de ambas religiones por igual).

Lo más significativo, las tres principales cargos de la Constitución (presidente, primer ministro y presidente de la Asamblea Nacional) fueron asignados a un maronita (cristiano), un sunita (musulmán) y un chiita (musulmán).