Barnim gobernó durante un tiempo en común con su hermano mayor Jorge I; y después de la muerte de Jorge en 1531 compartió el ducado con su sobrino Felipe I, reteniendo para sí mismo el ducado de Pomerania-Stettin.

En 1529, sin embargo, se firmó un tratado que liberaba a Pomerania de la supremacía de Brandeburgo con la condición de que si la familia ducal se extinguía el ducado sería integrado a Brandeburgo.

Barnim adoptó las doctrinas de Martín Lutero, y se unió a la liga de Esmalcalda, pero no tomó parte en la subsiguiente guerra.

Pero como esta actitud dejó a Barnim sin partidarios fue obligado a someterse al emperador Carlos V, pagar una fuerte multa, y aceptar el Interim, emitido desde Augsburgo en mayo de 1548.

También Johann von Falcken[1]​ fue elegido Canciller porque su antigua noble familia estaba en contacto estrecho con Carlos V.