En 1520 obtuvo el arcedianato de Niebla y en 1532 se trasladó a Sevilla por orden del papa Clemente VII con la finalidad de dirimir la solicitud de dispensa en cuarto grado de consanguinidad para el matrimonio entre Juan Téllez de Girón y María Enríquez.
[1][2][3][4][5] Durante el periodo que vivió en esta ciudad dotó a sus expensas una capilla de la Catedral, que desde entonces recibe el nombre de Capilla de Scala en honor de su fundador, y está dedicada a la Virgen de Consolación y los apóstoles.
Fundó una cofradía con la finalidad de socorrer a los pobres, tras comprobar la gran mortalidad que ocasionó una hambruna en 1521, que provocó un motín popular que se ha llamado Motín del pendón verde.
Con la intención de custodiar el trigo que habría de darse como limosna a los pobres compró un edificio destinado a granero ubicado en las proximidades del Archivo de Indias.
[6] En 1531 instituyó un concurso literario para alentar a los jóvenes al estudio de la oratoria y la poesía, las tres primeras ediciones se celebraron en el Palacio arzobispal de Sevilla.