Los grandes daños infligidos durante la guerra paralizaron casi por completo la producción de petróleo en la zona, y no fue sino hasta 1950 que la actividad recomenzó luego que Royal Dutch Shell realizara cuantiosas inversiones para reparar los daños producidos durante la guerra.
La CIA, Taiwán y las Filipinas habían provisto a los rebeldes del grupo Permesta en Sulawesi del Norte con cierta capacidad aérea insurgente, el Angkatan Udara Revolusioner (AUREV).
La primera dañó la pista de aterrizaje del aeropuerto, la segunda le prendió fuego y hundió el buque tanque petrolero británico San Flaviano[7][8] y la tercera golpeó contra el buque tanque inglés Daronia sin explotar.
[11][12] Inmediatamente Estados Unidos retiró el apoyo que le brindaba a Permesta, con lo cual la magnitud de la rebelión se redujo rápidamente.
Pertamina abrió su sede en Borneo Oriental en la ciudad, seguida de sucursales establecidas por otras compañías petroleras internacionales.
Las colinas son menos de 100 metros (330 pies) más altas que los valles adyacentes.
La mayor parte del suelo en Balikpapan contiene suelo podsólico de color amarillo rojizo y arena aluvial y de cuarzo, lo que lo hace extremadamente propenso a la erosión.
Balikpapan generalmente muestra poca variación en el clima a lo largo del año.