La bahía de Apalachicola (del inglés: Apalachicola Bay) es un amplio estuario y lagoon ubicado en la costa noroeste del estado de Florida, conocida por sus ostras.

Cuatro islas separan el sistema del golfo de México; la isla St.

El intercambio de agua se produce a través de los pasos Indian, West y East y del canal Duer.

El lagoon ha sido designado como una Reserva Nacional de Investigación Estuarina (National Estuarine Research Reserve) y el río Apalachicola es la mayor fuente de agua dulce al estuario.

La región cuenta con 1.162 especies de plantas, e incluye el mayor conjunto natural de árboles tupelo del mundo.