Tras esto, Dan Truman decide traer al mejor perforador del mundo, Harry S. Stamper, para realizar la misión.

La misión consistirá en que dos grupos repartidos en dos transbordadores espaciales, el Libertad y el Independencia, tendrán que acoplarse a la MIR (estación espacial rusa), cargar las naves con combustible, prepararse para dar una vuelta a la Luna utilizando su gravedad y aterrizar justo cuando el asteroide pase al lado de esta, y los restos de la cola sean atraídos por la gravedad lunar.

Tras llegar al asteroide, tendrán que usar los armadillos, unos sofisticados vehículos equipados con las máquinas necesarias para perforar y con ellos, perforar hasta los 240 m, colocar una bomba atómica e irse de allí, todo esto antes de que el asteroide haya pasado la denominada «barrera cero», es decir, una distancia límite calculada en 60.000 km para que los dos trozos de asteroide restantes tras la explosión atómica, se separen lo suficiente como para no colisionar con la Tierra.

Tras recibir un duro entrenamiento, se preparan para despegar justo un día después de que un trozo del asteroide colisionara en Shanghái, destruyendo la ciudad y provocando un tsunami, matando a cerca de 50.000 personas y haciendo público que un meteorito se aproxima a la Tierra.

Y aun así, por primera vez en la Historia del planeta, las especies tienen la tecnología para evitar su propia extinción.

La sed humana por la excelencia y el conocimiento, todos los escalones en la escalera de la ciencia, cada aventura hacia el espacio, todas nuestras tecnologías modernas combinadas e imaginadas, e incluso las guerras que peleamos nos proporcionaron las herramientas para librar esta terrible batalla.

Los sueños de todo un planeta esta noche están enfocados en esas catorce almas valientes que viajarán por los cielos.

Luego, los astronautas se dirigen a la Luna para usar su gravedad e impulsarse hacia el asteroide.

Mientras tanto en la Tierra, descubren que la gravedad lunar afecta a las comunicaciones y que en doce minutos, tal vez ya no puedan contactar más con el transbordador y perderán la capacidad para detonar la bomba a control remoto de forma permanente.

Tras una discusión que es detenida cuando la bomba es desactivada remotamente desde la NASA, Harry está a punto de estrangular al coronel Sharp, pero se detiene y le jura al Coronel Sharp que si desactiva la bomba, logrará perforar hasta los 240 m. y terminar la misión.

Se ponen manos a la obra y continúan perforando, pero tras un temblor producido al topar con una cueva llena de gas en la perforación, esta explota bajo el armadillo que Max pilota y lo destruye lanzándolo al espacio, acabando con toda esperanza para la humanidad.

Un fragmento enorme del cometa cae en París a más de 30.000 kph arrasándola por completo.

Se disponen resignados a activar la bomba y marcharse, habiendo perforado tan sólo 165 m cuando el otro armadillo con A.J., Lev y Oso, tras muchas dificultades, logra llegar a donde se encuentra el equipo de Harry, devolviendo las esperanzas al mundo.

La poderosa onda expansiva sacude al Libertad mientras la tripulación es cegada por la intensa luz de la explosión.

Durante la boda, en atriles, están colocadas las fotografías de los que se sacrificaron en el asteroide para salvar al mundo: Harry, Oscar, Max y Freddy.

El álbum presenta varias canciones grabadas específicamente para la banda sonora, incluyendo "I Don't Want to Miss a Thing" y "What Kind of Love Are You On", por Aerosmith, "Remember Me", por Journey, y "Mister Big Time", interpretado por Jon Bon Jovi.

[5]​ Otra película similar, sobre el espacio, es Deep Impact, que se estrenó dos meses y medio antes de Armageddon en EE.