El nestorianismo se apoderó de las iglesias de la región y Beth Garmai fue una sede metropolitana nestoriana que comprendía al menos nueve sufragáneas.
Desde 1258 fue parte del Imperio mongol y de su sucesor el Ilkanato hasta 1336.
El último metropolitano conocido fue Shemon, mencionado en 1318 en la consagración del patriarca Timoteo II.
La fundación de la eparquía caldea se atribuye a Yukhannan Hormizd.
Sin embargo, esta tradición no está suficientemente respaldada por las fuentes, ya que en un colofón de 1798 Hormizd se indica como metropolitano de Mosul y Kirkuk y Abraham no es mencionado por ninguna otra fuente.
Con él comienza una serie ininterrumpida de eparcas hasta hoy y trasladó la residencia Kirkuk.
En 1851 la región se volvió parte del Imperio otomano hasta la ocupación británica de 1918.