Los Apartamentos Borgia o Aposentos Borgia son un conjunto de seis salas en el Palacio Apostólico Vaticano, que a fines del siglo XV fueron destinadas por el papa Alejandro VI (Rodrigo de Borja o Borgia) para uso propio.
Habiendo encargado, al pintor italiano Bernardino di Betto di Biagio (Pinturicchio o Pintoricchio) y sus ayudantes, la decoración de sus estancias con pinturas y frescos.
Las obras en los Apartamentos Borgia actualmente se consideran parte de la Biblioteca Vaticana.
Los Apartamentos Borgia comprenden: El historiador británico Marc Phillips menciona de estas salas lo siguiente: Debido a que los aposentos estaban íntimamente vinculados con la familia Borgia -odiada por sus enemigos, entre ellos su sucesor papa Julio II-, fueron abandonados en 1503, después del fallecimiento del papa Alejandro VI.
En 1889 el papa León XIII reabrió los apartamentos reacondicionados y accesibles al público.