[cita requerida]En 1936, el gobernador Amadeo Sabattini lo designó Ministro de Obras Públicas.
El ministro Medina Allende creó organismos fundamentales como las direcciones de Minas y la de Hidráulica desde la que se impulsaron iniciativas para la construcción de diques, escuelas, dispensarios, establecimientos de utilidad pública y la promoción del turismo y la agricultura.
Medina Allende estaba enrolado en la corriente radical sabattinista.
Esta facción política, detentaba el control de la Unión Cívica Radical de Córdoba y se oponía a los intentos de alianzas políticas en el orden nacional; tanto con líderes militares de la era del fraude —la Unión Cívica Radical Junta Renovadora había apoyado las candidaturas de Agustín P. Justo en 1942—; como con los partidos de izquierda, a quienes Amadeo Sabattini llamó portadores de "doctrinas económicas o principios científicos extraños a nuestra constitución social y política".
Así las cosas, se realizaron comicios internos el 16 de diciembre de 1945 en los que fueron elegidos el ex Vicegobernador de Córdoba Arturo Illia, presidente del Comité Central de la Provincia, y Antonio Medina Allende, candidato a gobernador; derrotando a Mauricio Yadarola, de la corriente "Núcleo Principista y Democrático" —denominada "unionista"—, quien solo se impuso en los departamentos Río Cuarto y San Javier.