[4] Tomó posesión canónica el día 31 del mismo mes, durante una ceremonia en la Catedral de Guayaquil.[10][11] Al día siguiente fue operado y le practicaron cuatro bypass coronarios.[13] Tras la elección del papa Francisco, manifestó que su designación: es una «extraordinaria noticia» para América Latina.[22] Durante la sabatina, el presidente Correa presentó una "carta de protesta" a la Nunciatura apostólica, alegando que "está prohibido por el derecho romano" la supuesta participación del arzobispo Arregui en política.[25] Durante misas de desagravio en Guayaquil y Quito, se dio respaldo a Arregui por las "ofensas" del secretario Alexis Mera; en las cuales se reflexionó sobre el respeto y el perdón.