Por este matrimonio ella se convirtió en emperatriz del Sacro Imperio Romano Germánico, reina de Alemania, reina de Bohemia y reina de Hungría.

Matías era su primo hermano; el emperador Maximiliano II, padre de Matías, era el hermano mayor del padre de Ana.

Ana falleció un año después y fue enterrada allí.

Tres meses más tarde, Matías murió y fue sepultado con Ana en la cripta imperial.

La mayor parte de los emperadores y emperatrices del Sacro Imperio Romano Germánico fueron enterrados, a partir de entonces, en la cripta imperial.