Representando al Partido Demócrata perdió las elecciones presidenciales de 1904 ante el republicano Theodore Roosevelt.
En 1904, derrotó al editor liberal William Randolph Hearst por la nominación del Partido Demócrata a la presidencia de los Estados Unidos.
En las elecciones generales, Parker se opuso al popular presidente republicano en ejercicio Theodore Roosevelt.
Después de una campaña desorganizada e ineficaz, Parker fue derrotado por 336 votos electorales contra 140.
Se desempeñó como delegado en la Convención Nacional Demócrata de 1884, en la que Cleveland fue nombrado candidato presidencial del partido; Cleveland pasó a derrotar por poco al republicano James G. Blaine en las elecciones de otoño.
[4] A medida que se acercaban las elecciones presidenciales de 1904, los demócratas comenzaron a buscar un candidato que se opusiera al popular presidente republicano en funciones, Theodore Roosevelt, y el nombre de Parker surgió como posible candidato.
Otros delegados hablaron de nominar a Cleveland, que ya había cumplido dos mandatos no consecutivos, pero Cleveland ya no era popular fuera del partido o incluso dentro de él, debido a su ruptura con Bryan.
Cuando la convención emitió sus votos, estaba claro que ningún candidato, excepto Parker, podía unificar al partido, y fue seleccionado en la primera votación.
El movimiento de la "plata libre", un elemento clave para el partido en 1896 y 1900, fue popular entre los agricultores occidentales endeudados que sentían que la inflación les ayudaría a pagar sus deudas.
[12] El telegrama provocó un nuevo debate y una nueva oposición de Bryan, pero la convención finalmente respondió a Parker que era libre de hablar sobre el tema como quisiera.
Roosevelt ganó todos los estados del norte y del oeste, incluido Misuri, por un total de 336 votos electorales; Parker ganó solamente el tradicionalmente democrático Sur Sólido, acumulando 140 votos electorales.