El Alto Estado Mayor (AEM) fue un órgano superior de las Fuerzas Armadas Españolas que funcionó entre 1939 y 1980, durante la dictadura franquista y la transición.

Tenía a su cargo las funciones de coordinación entre los estados mayores de las tres ejércitos (Armada, Ejército de Tierra y Ejército del Aire).

De esta manera queda constituido el Alto Estado Mayor con los siguientes cometidos: Para esto fue necesario por una parte el nombramiento de un General-Jefe que sería miembro y secretario de la Junta de Defensa Nacional, y por otro lado la creación de una secretaría y tres secciones: una militar, otra económica y una de información.

Por ello comenzó a funcionar una nueva agencia de inteligencia militar, la denominada "Tercera Sección de Información del Alto Estado Mayor".

El AEM desapareció en 1980 al asumir todas sus funciones la Junta de Jefes de Estado Mayor (JUJEM), siendo ésta sucedida en 1984 por el Estado Mayor de la Defensa (EMAD).