Esta última, puesta bajo su cuidado tras la muerte de su madre, tuvo una indiscreta conducta sexual debido a la poca supervisión de Tilney, lo que posteriormente la llevaría a ser ejecutada por traición.

En 1501 se convirtió en miembro del Consejo Privado, mientras que el 16 de junio fue nombrado Gran Tesorero.

[4]​[5]​ La duquesa viuda siguió contando con el favor real tras el deceso de su esposo.

Las ordenanzas emitidas en Eltham Palace en 1526 indican que Agnes ocupaba el primer puesto en la corte de la reina tras la hermana del rey María Tudor.

[11]​ Pese al gran amor que Enrique sentía por Catalina,[12]​ a quien al parecer llamaba su «rosa sin espinas», el matrimonio pronto demostró ser desastroso.

El 14 de diciembre de 1541, Norfolk, temiendo por su seguridad, denunció a su madrastra y redactó una carta al rey en la cual vertía toda la culpa sobre Agnes y Catalina.

El 7 de febrero de 1542 se aprobó contra Catalina y Jane Rochford un bill of attainder (acto legislativo mediante el cual se condena, a menudo sin juicio, a una o varias personas), siendo ambas decapitadas el 13 de febrero en la Torre Verde.

El rey consideraba que había razones para condenar a la duquesa viuda por traición del mismo modo que a Dereham, si bien el Consejo instó clemencia en su caso, tras lo cual Agnes fue liberada el 5 de mayo de 1542.

Su hijastro, el duque de Norfolk, evitó ser castigado, aunque nunca volvió a contar con la entera confianza del monarca.

[21]​ Agnes falleció en mayo de 1545 y fue enterrada en Thetford Priory el 31 del mismo mes.