[10] En relación a los quechuas sureños, la única diferencia sustancial respecto del alfabeto de 1975 era la implementación de tres únicas letras vocálicas 'a', 'i' y 'u' para ambas lenguas (siguiendo el mismo criterio fonológico ya adoptado con las consonantes).
En 2007, se introdujo un cambio normativo por el que la persona jurídica creada por la ley de 1990 pasaba de ser una "institución pública descentralizada del Sector Educación" a ser un "organismo público descentralizado" (OPD).
[15] Es un asunto disputado si la AMLQ en operaciones es o no la persona jurídica de derecho público establecida por la normativa.
[16] En los considerandos de la resolución ministerial al respecto se enuncia la que es hasta hoy la posición jurídica oficial del Estado sobre la AMLQ: En noviembre del 2009, su entonces presidente Juan Incaroca denunció que un grupo de exdirectivos de la Academia habrían ingresado a su local forzando las cerraduras y sustrayendo bastante documentación administrativa.
[24] Aunque su portal institucional presenta una sección dedicada a ello, su actual Estatuto no es público.
En diciembre del 2023, su junta directiva estaba integrada por Fernando Hermoza, David Quispe Orosco, Miguel Sánchez Andia, Julia Qquenaya Apaza y Ronal Cjuyro Mescco.
[29] David Samanez Flórez, miembro de la Academia, ha seguido sosteniendo el origen cusqueño de la lengua quechua, que según él tendría presencia en la zona desde la época precerámica[30] idea desmentida por los especialistas desde los años sesenta.
[31][32] Según Samanez, contrariamente a todas las clasificaciones serias, la división principal entre las lenguas quechuas sería entre la variedad cuzqueño-boliviana y una rama que agruparía a todas los demás quechuas.
[33] Hasta los años ochenta, su entonces presidente seguía afirmando que todas las demás lenguas quechuas "derivaban" del dialecto cuzqueño.
Según la AMLQ, por Resolución Presidencial No 001 del 12 de octubre de 1990 se "ratifica el Alfabeto Básico del Quechua Imperial de 1975 compuesto de 31 grafemas: cinco vocales y 26 consonantes para Qosqo-Puno"[27] Aunque en el pasado han editado varias revistas, como Inka Rimay, hoy su principal publicación es el diccionario Simi Taqe, aparecido originalmente en 1995 y que ha sido reeditado múltiples veces (sobre sus críticas, ver sección correspondiente).
[10] Del mismo modo, su criticado diccionario oficial fue patrocinado por la Municipalidad Provincial en 1995 y por el Gobierno Regional en 2005.
En 2016, el Gobierno Regional del Cusco emitió una ordenanza que, aunque no menciona a la AMLQ, declaró la lengua quechua como idioma "completo y pentavocal", y estableciendo su enseñanza obligatoria en la región:
La ordenanza mencionaba como sustento un supuesto informe técnico del Departamento de Lingüística de la Universidad Nacional San Antonio Abad del Cusco, que fue solicitado sin éxito por las autoridades educativas al gobierno regional.