Niveles bajos de 5-HIAA en el líquido cefalorraquídeo se asocia con conducta agresiva y tendencias suicidas con violencia, estando correlacionado con niveles bajos de serotonina cerebral.

El ácido 5 hidroxindolacético además tiene otros los límites normales de 2-8 micro gramos sobre 24 horas considerando esto como niveles normales, si se llegan a elevar una de las causas es el tumor carcinoma también puede ser por ingerir alimentos como ciruelas, aguacates, glicerol, guayaco lato, paracetamol, salicílicos, fenociatiacinas, imipramina, metocarbamol, reserpina y metanfetamina de una forma excesiva.

Estas cantidades pueden no reflejarse enteramente en los niveles de 5-HIAA en orina, porque la serotonina se metaboliza poco.

Tumores derivados de células del digestivo anterior (carcinoides bronquial, pancreático, duodenal, o biliar) producen grandes cantidades de serotonina, que pueden ser oxidadas a 5-HIAA por el propio tumor.

Con estos tumores, la excreción urinaria de 5-HIAA es frecuentemente más elevada que lo esperado.