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Pseudomonadota

Clasificación

Pseudomonadota (sinónimo Proteobacteria ) es un filo importante de bacterias Gram-negativas . El cambio de nombre de varios filos de procariotas en 2021, incluido Pseudomonadota, sigue siendo controvertido entre los microbiólogos, muchos de los cuales continúan usando el nombre anterior Proteobacteria, de larga data en la literatura. [10] El filo Pseudomonadota abarca las clases Acidithiobacilia, Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Hydrogenophilia y Zetaproteobacteria. [11] El filo incluye una amplia variedad de géneros patógenos , como Escherichia , Salmonella , Vibrio , Yersinia , Legionella y muchos otros. [12] Otras son de vida libre (no parasitarias ) e incluyen muchas de las bacterias responsables de la fijación de nitrógeno .

Carl Woese estableció esta agrupación en 1987, llamándola informalmente "bacterias moradas y sus parientes". [13] Debido a la gran diversidad de formas encontradas en este grupo, más tarde se le llamó informalmente Proteobacteria, en honor a Proteus , un dios griego del mar capaz de asumir muchas formas diferentes (no en honor al género Proteobacteria Proteus ). [6] [14] En 2021, el Comité Internacional de Sistemática de Procariotas designó el sinónimo Pseudomonadota. [1]

Anteriormente, el filo Pseudomonadota incluía dos clases adicionales, a saber, Deltaproteobacteria y Oligoflexia . Sin embargo, una investigación adicional sobre la filogenia de estos taxones mediante el análisis de marcadores genómicos demostró su separación del filo Pseudomonadota. [15] Las deltaproteobacterias han sido identificadas como una unidad taxonómica diversa, lo que llevó a una propuesta para su reclasificación en filos distintos: Desulfobacterota (que abarca las termodesulfobacterias ), Myxococcota y Bdellovibrionota (que comprende Oligoflexia ). [15]

La clase Epsilonprotobacteria también se identificó dentro del filo Pseudomonadota. Esta clase se caracteriza por su importancia como productores primarios quimiolitotróficos y su destreza metabólica en ecosistemas de respiraderos hidrotermales de aguas profundas. [16] Los géneros patógenos notables dentro de esta clase incluyen Campylobacter, Helicobacter y Arcobacter . El análisis de la topología del árbol filogenético y los marcadores genéticos reveló la divergencia directa de Epsilonprotobacteria del filo Pseudomonadota. [16] Los datos limitados de exogrupos y los bajos valores de arranque respaldan estos descubrimientos. A pesar de más investigaciones, no se ha llegado a un consenso sobre la naturaleza monofilética de Epsilonproteobacteria dentro de Proteobacteria, lo que llevó a los investigadores a proponer su separación taxonómica del filo. La reclasificación propuesta del nombre Epsilonprotobacteria es Campylobacterota . [dieciséis]

Características

Todas las Pseudomonadota (Proteobacterias) son diversas. Son nominalmente Gram negativos , aunque en la práctica algunos pueden teñirse de Gram positivos o Gram variables. Su membrana externa está compuesta principalmente por lipopolisacáridos . Muchos se mueven usando flagelos , pero algunos no son móviles o dependen del deslizamiento bacteriano . [ cita necesaria ]

Pseudomonadota tiene una amplia variedad de tipos de metabolismo . La mayoría son anaeróbicos facultativos u obligados , quimiolitoautótrofos y heterótrofos , pero se producen numerosas excepciones. Una variedad de géneros, que no están estrechamente relacionados entre sí, convierten la energía de la luz mediante la fotosíntesis convencional o la fotosíntesis anoxigénica . [ cita necesaria ]

Algunas alfaproteobacterias pueden crecer con niveles muy bajos de nutrientes y tener una morfología inusual, como tallos y yemas. Otros incluyen bacterias de importancia agrícola capaces de inducir la fijación de nitrógeno en simbiosis con las plantas. El orden tipo es Caulobacterales , que comprende bacterias formadoras de tallos como Caulobacter . Se cree que las mitocondrias de los eucariotas descienden de una alfaproteobacteria. [17]

Las Betaproteobacterias son metabólicamente muy diversas y contienen quimiolitoautótrofos , fotoautótrofos y heterótrofos generalistas . El orden tipo es el Burkholderiales , que comprende una enorme variedad de diversidad metabólica, incluidos patógenos oportunistas . [ cita necesaria ]

Las gammaproteobacterias son la clase más grande en términos de especies con nombres publicados válidamente. El orden tipo es el Pseudomonadales , que incluye los géneros Pseudomonas y el fijador de nitrógeno Azotobacter . [ cita necesaria ]

Las Zetaproteobacterias son quimiolitoautótrofos neutrófilos oxidantes del hierro , distribuidos mundialmente en estuarios y hábitats marinos. El orden tipo es el Mariprofundales . [ cita necesaria ]

Los hidrogenofiliales son termófilos obligados e incluyen heterótrofos y autótrofos. El orden tipo es el Hydrogenophilales . [ cita necesaria ]

Los Acidithiobacillia contienen únicamente autótrofos que oxidan azufre, hierro y uranio . El orden tipo es Acidithiobacillales , que incluye organismos económicamente importantes utilizados en la industria minera como Acidithiobacillus spp. [ cita necesaria ]

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con vigencia en la nomenclatura (LSPN) [18] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [19]

El grupo se define principalmente en términos de secuencias de ARN ribosómico (ARNr). Los Pseudomonadota se dividen en varias clases. Anteriormente se consideraban subclases del filo, pero ahora se tratan como clases . Estas clases son monofiléticas . [20] [21] [22] El género Acidithiobacillus , parte de las Gammaproteobacterias hasta que fue transferido a la clase Acidithiobacillia en 2013, [2] anteriormente se consideraba parafilético para las Betaproteobacterias según estudios de alineación multigenoma . [23] En 2017, Betaproteobacteria estuvo sujeta a revisiones importantes y se creó la clase Hydrogenophilalia para contener el orden Hydrogenophilales [4]

Las clases de Pseudomonadota con nombres publicados válidamente incluyen algunos géneros destacados: [24] por ejemplo:

Transformación

La transformación , un proceso en el que el material genético pasa de una bacteria a otra, [31] se ha informado en al menos 30 especies de Pseudomonadota distribuidas en las clases alfa, beta y gamma. [32] Los Pseudomonadota mejor estudiados con respecto a la transformación genética natural son los patógenos humanos de importancia médica Neisseria gonorrhoeae (clase beta) y Haemophilus influenzae (clase gamma). [33] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio y la integración de la secuencia del donante en el genoma del receptor. En Pseudomonadota patógena, la transformación parece servir como un proceso de reparación del ADN que protege el ADN del patógeno del ataque de las defensas fagocíticas de su huésped que emplean radicales libres oxidativos . [33]

Ver también

Referencias

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enlaces externos

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