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Péptidos antimicrobianos

Varias estructuras de péptidos antimicrobianos.

Los péptidos antimicrobianos ( AMP ), también llamados péptidos de defensa del huésped ( HDP ), son parte de la respuesta inmune innata que se encuentra en todas las clases de vida. Existen diferencias fundamentales entre las células procarióticas y eucariotas que pueden representar objetivos para los péptidos antimicrobianos . Estos péptidos son antimicrobianos potentes y de amplio espectro que demuestran potencial como nuevos agentes terapéuticos. Se ha demostrado que los péptidos antimicrobianos matan bacterias Gram negativas y Gram positivas , [1] virus envueltos, hongos e incluso células transformadas o cancerosas. [2] A diferencia de la mayoría de los antibióticos convencionales, parece que los péptidos antimicrobianos con frecuencia desestabilizan las membranas biológicas , pueden formar canales transmembrana y también pueden tener la capacidad de mejorar la inmunidad al funcionar como inmunomoduladores .

Estructura

Péptidos antimicrobianos de animales, plantas y hongos organizados por su contenido de estructura secundaria. El tamaño del círculo indica el peso molecular general de cada péptido.

Los péptidos antimicrobianos son un grupo único y diverso de moléculas, que se dividen en subgrupos según su composición y estructura de aminoácidos. [3] Los péptidos antimicrobianos generalmente tienen entre 12 y 50 aminoácidos. Estos péptidos incluyen dos o más residuos cargados positivamente proporcionados por arginina , lisina o, en ambientes ácidos, histidina , y una gran proporción (generalmente >50%) de residuos hidrofóbicos. [4] [5] [6] Las estructuras secundarias de estas moléculas siguen 4 temas, que incluyen i) hélice α , ii) cadena β debido a la presencia de 2 o más enlaces disulfuro , iii) horquilla β o bucle debido a la presencia de un único enlace disulfuro y/o ciclación de la cadena peptídica, y iv) extendida. [7] Muchos de estos péptidos no están estructurados en solución libre y se pliegan en su configuración final al dividirse en membranas biológicas. Los péptidos contienen residuos de aminoácidos hidrófilos alineados a lo largo de un lado y residuos de aminoácidos hidrófobos alineados a lo largo del lado opuesto de una molécula helicoidal. [3] Esta anfipaticidad de los péptidos antimicrobianos les permite dividirse en la bicapa lipídica de la membrana. La capacidad de asociarse con membranas es una característica definitiva de los péptidos antimicrobianos, [8] [9] aunque la permeabilización de la membrana no es necesaria. Estos péptidos tienen una variedad de actividades antimicrobianas que van desde la permeabilización de la membrana hasta la acción sobre una variedad de objetivos citoplasmáticos. [ cita necesaria ]

Actividades

Los modos de acción de los péptidos antimicrobianos.

Los modos de acción mediante los cuales los péptidos antimicrobianos matan a los microbios son variados [10] y pueden diferir para diferentes especies bacterianas. [11] Algunos péptidos antimicrobianos matan tanto bacterias como hongos, por ejemplo, la psoriasina mata E. coli y varios hongos filamentosos. [12] La membrana citoplasmática es un objetivo frecuente, pero los péptidos también pueden interferir con la síntesis de ADN y proteínas , el plegamiento de proteínas y la síntesis de la pared celular. [10] El contacto inicial entre el péptido y el organismo objetivo es electrostático, ya que la mayoría de las superficies bacterianas son aniónicas o hidrofóbicas, como en el péptido antimicrobiano piscidina. Su composición de aminoácidos, anfipaticidad, carga catiónica y tamaño les permiten unirse e insertarse en bicapas de membrana para formar poros mediante mecanismos de "barril-duela", "alfombra" o "poro toroidal". Alternativamente, pueden penetrar en la célula para unirse a moléculas intracelulares que son cruciales para la vida celular. [13] Los modelos de unión intracelular incluyen la inhibición de la síntesis de la pared celular, la alteración de la membrana citoplasmática, la activación de la autolisina, la inhibición de la síntesis de ADN, ARN y proteínas, y la inhibición de ciertas enzimas. En muchos casos, se desconoce el mecanismo exacto de la muerte. Una técnica emergente para el estudio de tales mecanismos es la interferometría de polarización dual . [14] [15] A diferencia de muchos antibióticos convencionales, estos péptidos parecen ser bactericidas [2] en lugar de bacteriostáticos . En general, la actividad antimicrobiana de estos péptidos se determina midiendo la concentración mínima inhibidora (CMI), que es la concentración más baja de fármaco que inhibe el crecimiento bacteriano. [dieciséis]

Los AMP pueden poseer múltiples actividades, incluidas actividades bacterianas antigrampositivas, bacterianas antigramnegativas, antifúngicas, antivirales, antiparasitarias y anticancerígenas. Un gran análisis funcional de AMP indica que entre todas las actividades de AMP, anfipaticidad y carga, dos propiedades principales de los AMP, distinguen mejor entre los AMP con y sin actividades bacterianas antigramnegativas. [17] Esto implica que ser AMP con actividades bacterianas antigramnegativas puede preferir o incluso requerir una fuerte anfipaticidad y carga neta positiva. [ cita necesaria ]

Inmunomodulación

Además de matar bacterias directamente, se ha demostrado que tienen una serie de funciones inmunomoduladoras que pueden estar implicadas en la eliminación de la infección, incluida la capacidad de alterar la expresión genética del huésped, actuar como quimiocinas y/o inducir la producción de quimiocinas , inhibiendo la producción inducida por lipopolisacáridos . -producción de citoquinas inflamatorias , favoreciendo la cicatrización de heridas y modulando las respuestas de las células dendríticas y de las células de la respuesta inmune adaptativa. Los modelos animales indican que los péptidos de defensa del huésped son cruciales tanto para la prevención como para la eliminación de la infección. Parece que muchos péptidos inicialmente aislados y denominados "péptidos antimicrobianos" han demostrado tener funciones alternativas más significativas in vivo (por ejemplo, hepcidina [18] ). Dusquetida, por ejemplo, es un inmunomodulador que actúa a través de p62, una proteína implicada en la señalización de infección basada en receptores tipo peaje. Soligenix (SGNX) está examinando el péptido en un ensayo clínico de fase III para determinar si puede ayudar en la reparación del daño inducido por la radiación en la mucosa oral que surge durante la radioterapia contra el cáncer de cabeza y cuello. [19]

Mecanismos de acción

Imágenes de microscopía electrónica de barrido (aumento de 50.000X) que muestran la acción de un péptido antimicrobiano experimental (NN2_0050) en la membrana celular de E. coli (K12 MG1655) [1] ARRIBA: Membranas celulares intactas en el grupo de control. ABAJO: Membranas celulares alteradas y fuga de cromosoma bacteriano (verde) en el grupo tratado.

Los péptidos antimicrobianos generalmente tienen una carga neta positiva, lo que les permite interactuar con las moléculas cargadas negativamente expuestas en las superficies de las bacterias y las células cancerosas, como los fosfolípidos fosfatidilserina, las mucinas O-glicosiladas, los gangliósidos sialilados y los sulfatos de heparina. El mecanismo de acción de estos péptidos varía ampliamente, pero se puede simplificar en dos categorías: péptidos antimicrobianos membranolíticos y no membranolíticos. [20] La alteración de las membranas por péptidos antimicrobianos membranolíticos se puede describir mediante cuatro modelos: [20]

Representación esquemática de los mecanismos de acción de los AMP al alterar las membranas. [22]

Se han utilizado varios métodos para determinar los mecanismos de la actividad de los péptidos antimicrobianos. [11] [13] En particular, los estudios de RMN de estado sólido han proporcionado una explicación de resolución a nivel atómico de la alteración de la membrana por péptidos antimicrobianos. [23] [24] En años más recientes, la cristalografía de rayos X se ha utilizado para delinear con detalle atómico cómo la familia de defensinas vegetales rompe las membranas mediante la identificación de fosfolípidos clave en las membranas celulares del patógeno. [25] [26] Se cree que las defensinas humanas actúan a través de un mecanismo similar, dirigiéndose a los lípidos de la membrana celular como parte de su función. De hecho, ahora se ha demostrado que la beta-defensina 2 humana mata el hongo patógeno Candida albicans mediante interacciones con fosfolípidos específicos. [27] Desde el punto de vista computacional, las simulaciones de dinámica molecular pueden proporcionar información detallada sobre la estructura y dinámica de las interacciones péptido-membrana, incluida la orientación, conformación e inserción del péptido en la membrana, así como interacciones peptídicas específicas. con lípidos, iones y disolvente. [28]

Investigación y uso terapéutico.

Se han utilizado péptidos antimicrobianos como agentes terapéuticos; su uso generalmente se limita a la administración intravenosa o aplicaciones tópicas debido a su corta vida media. En enero de 2018, los siguientes péptidos antimicrobianos estaban en uso clínico: [29]

Actividad más allá de las funciones antibacterianas.

Se ha observado que los AMP tienen funciones distintas a la destrucción de bacterias y hongos. Estas actividades incluyen efectos antivirales, pero también funciones en la defensa del huésped, como funciones anticancerígenas y funciones en neurología. [30] Esto ha llevado a un movimiento para cambiar la marca de los AMP como "péptidos de defensa del huésped" para abarcar el amplio alcance de actividades que pueden tener los AMP. [31]

Propiedades anticancerígenas

Algunas cecropinas (por ejemplo, cecropina A y cecropina B) tienen propiedades anticancerígenas y se denominan péptidos anticancerígenos (ACP). [32] :  Se han estudiado 3 ACP híbridos basados ​​en Cecropin A para determinar sus propiedades anticancerígenas. [32] : 7.1  La mosca de la fruta, la defensina, previene el crecimiento tumoral, y se sospecha que se une a las células tumorales debido a modificaciones de la membrana celular comunes a la mayoría de las células cancerosas, como la exposición a la fosfatidilserina . [33]

Propiedades antibiopelículas

La cecropina A puede destruir células de E. coli uropatógenas (UPEC) formadoras de biopelículas planctónicas y sésiles , ya sea sola o en combinación con el antibiótico ácido nalidíxico , eliminando sinérgicamente la infección in vivo (en el insecto huésped Galleria mellonella ) sin citotoxicidad fuera del objetivo. El mecanismo de acción multiobjetivo implica la permeabilización de la membrana externa seguida de la alteración de la biopelícula provocada por la inhibición de la actividad de la bomba de eflujo y las interacciones con los ácidos nucleicos extracelulares e intracelulares. [34]

Otras investigaciones

Recientemente se han realizado algunas investigaciones para identificar posibles péptidos antimicrobianos de procariotas, [35] organismos acuáticos como peces, [36] [37] y mariscos, [38] y monotremas como los equidnas. [39] [40]

Selectividad

En la competencia de las células bacterianas y las células huésped con los péptidos antimicrobianos, los péptidos antimicrobianos interactuarán preferentemente con la célula bacteriana y las células de mamífero, lo que les permite matar microorganismos sin ser significativamente tóxicos para las células de mamífero. [41]

Con respecto a las células cancerosas , ellas mismas también secretan péptidos antimicrobianos humanos, incluida la defensina , y en algunos casos, se informa que son más resistentes que las células normales circundantes. Por lo tanto, no podemos concluir que la selectividad sea siempre alta contra las células cancerosas. [42] [43]

Factores

Hay algunos factores que están estrechamente relacionados con la propiedad de selectividad de los péptidos antimicrobianos, entre los cuales la propiedad catiónica contribuye más. Dado que la superficie de las membranas bacterianas está más cargada negativamente que las células de los mamíferos, los péptidos antimicrobianos mostrarán diferentes afinidades hacia las membranas bacterianas y las membranas de las células de los mamíferos. [44]

Además, también existen otros factores que afectarán a la selectividad. Es bien sabido que el colesterol normalmente se distribuye ampliamente en las membranas celulares de los mamíferos como agente estabilizador de membranas, pero está ausente en las membranas celulares bacterianas (excepto cuando es secuestrado por H. pylori ); [45] y la presencia de estos colesteroles también generalmente reducirá las actividades de los péptidos antimicrobianos, debido a la estabilización de la bicapa lipídica o a las interacciones entre el colesterol y el péptido. Entonces, el colesterol en las células de los mamíferos protegerá a las células del ataque de los péptidos antimicrobianos. [46]

Además, es bien sabido que el potencial transmembrana afecta las interacciones péptido-lípido. [47] Existe un potencial transmembrana interno negativo que existe desde la valva externa hasta la valva interna de las membranas celulares y este potencial transmembrana interno negativo facilitará la permeabilización de la membrana, probablemente al facilitar la inserción de péptidos cargados positivamente en las membranas. En comparación, el potencial transmembrana de las células bacterianas es más negativo que el de las células de mamíferos normales, por lo que la membrana bacteriana será propensa a ser atacada por péptidos antimicrobianos cargados positivamente. [ cita necesaria ]

De manera similar, también se cree que el aumento de la fuerza iónica , [46] que en general reduce la actividad de la mayoría de los péptidos antimicrobianos, contribuye parcialmente a la selectividad de los péptidos antimicrobianos al debilitar las interacciones electrostáticas requeridas para la interacción inicial.

Base molecular de la selectividad celular de los péptidos antimicrobianos.

Mecanismo

Las membranas celulares de las bacterias son ricas en fosfolípidos ácidos , como el fosfatidilglicerol y la cardiolipina . [41] [48]

Por el contrario, la parte exterior de las membranas de plantas y mamíferos está compuesta principalmente de lípidos sin cargas netas, ya que la mayoría de los lípidos con grupos de cabeza cargados negativamente están principalmente secuestrados en la valva interna de las membranas plasmáticas. [44] Así, en el caso de las células de mamíferos, las superficies exteriores de las membranas suelen estar hechas de fosfatidilcolina zwitteriónica y esfingomielina , aunque una pequeña porción de las superficies exteriores de la membrana contienen algunos gangliósidos cargados negativamente . Por lo tanto, la interacción hidrofóbica entre la cara hidrofóbica de los péptidos antimicrobianos anfipáticos y los fosfolípidos zwitteriónicos en la superficie celular de las membranas celulares de mamíferos juega un papel importante en la formación de la unión péptido-célula. [49]

La interferometría de polarización dual se ha utilizado in vitro para estudiar y cuantificar la asociación con el grupo de cabeza, la inserción en la bicapa, la formación de poros y la eventual rotura de la membrana. [50] [51]

Control

Se han puesto muchos esfuerzos en controlar la selectividad celular. Por ejemplo, se han realizado intentos de modificar y optimizar los parámetros fisicoquímicos de los péptidos para controlar las selectividades, incluyendo carga neta, helicidad , hidrofobicidad por residuo (H), momento hidrofóbico (μ) y el ángulo subtendido por la hélice polar cargada positivamente. cara (Φ). [47] Se cree que otros mecanismos, como la introducción de D- aminoácidos y aminoácidos fluorados en la fase hidrofóbica, rompen la estructura secundaria y, por lo tanto, reducen la interacción hidrofóbica con las células de mamíferos. También se ha descubierto que la sustitución de Pro→Nlys en péptidos antimicrobianos de giro β que contienen Pro era una estrategia prometedora para el diseño de nuevos péptidos antimicrobianos selectivos de células bacterianas pequeñas con mecanismos de acción intracelular. [52] Se ha sugerido que la unión directa de magainina a la superficie del sustrato disminuyó la unión celular inespecífica y condujo a un límite de detección mejorado para células bacterianas como Salmonella y E. coli . [53]

Resistencia bacteriana

Las bacterias utilizan diversas estrategias de resistencia para evitar la muerte de los péptidos antimicrobianos. [13]

Si bien estos ejemplos muestran que la resistencia puede evolucionar de forma natural, existe una creciente preocupación de que el uso de copias farmacéuticas de péptidos antimicrobianos pueda hacer que la resistencia se produzca con mayor frecuencia y rapidez. En algunos casos, la resistencia a estos péptidos utilizados como productos farmacéuticos para tratar problemas médicos puede provocar resistencia, no sólo a la aplicación médica de los péptidos, sino a la función fisiológica de esos péptidos. [62] [63]

El enfoque del "caballo de Troya" para resolver este problema aprovecha la necesidad innata de hierro de los patógenos. El “contrabando” de antimicrobianos hacia el patógeno se logra vinculándolos a sideróforos para su transporte. Si bien su concepto es simple, se han necesitado muchas décadas de trabajo para superar el difícil obstáculo de transportar antimicrobianos a través de las membranas celulares de los patógenos. Se han revisado las lecciones aprendidas de los éxitos y fracasos de los fármacos conjugados de sideróforo evaluados durante el desarrollo de nuevos agentes utilizando el enfoque del "caballo de Troya". [64]

Ejemplos

Moscas de la fruta infectadas por bacterias productoras de GFP. Las moscas de ojos rojos que carecen de genes de péptidos antimicrobianos son susceptibles a la infección, mientras que las moscas de ojos blancos tienen una respuesta inmune de tipo salvaje.

Los péptidos antimicrobianos son producidos por especies del árbol de la vida, que incluyen:

En los últimos años ha aumentado la investigación para desarrollar imitadores de péptidos antimicrobianos diseñados artificialmente como SNAPP , en parte debido al costo prohibitivo de producir AMP de origen natural. [69] Un ejemplo de esto es el péptido catiónico facial C18G, que fue diseñado a partir del dominio C-terminal del factor IV plaquetario humano. [70] Actualmente, el péptido antimicrobiano más utilizado es la nisina ; Al ser el único péptido antimicrobiano aprobado por la FDA , se usa comúnmente como conservante artificial. [71]

Bioinformática

Existen varias bases de datos bioinformáticas para catalogar los péptidos antimicrobianos. ElLa base de datos de péptidos antimicrobianos ( APD ) es la base de datos original y modelo para péptidos antimicrobianos (https://aps.unmc.edu). Sobre la base de la APD, también se han creado otras bases de datos, incluida ADAM (una base de datos de péptidos antimicrobianos), [72] BioPD (base de datos de péptidos biológicamente activos), CAMP (colección de secuencias y estructuras de péptidos antimicrobianos), [73] DBAASP (Base de datos de actividad antimicrobiana y estructura de péptidos), DRAMP (Repositorio de datos de péptidos antimicrobianos) Bienvenido a la base de datos Dramp, [74] y LAMP (Linking AMP).

Las bases de datos de péptidos antimicrobianos se pueden dividir en dos categorías según la fuente de péptidos que contienen, como bases de datos específicas y bases de datos generales. Estas bases de datos cuentan con diversas herramientas para el análisis y predicción de péptidos antimicrobianos. Por ejemplo, la APD tiene una interfaz de cálculo muy utilizada. También proporciona enlaces a muchas otras herramientas. CAMP contiene predicción de AMP, calculadora de funciones, búsqueda BLAST, ClustalW, VAST, PRATT, rueda helicoidal, etc. Además, ADAM permite a los usuarios buscar o navegar a través de relaciones secuencia-estructura de AMP. Los péptidos antimicrobianos a menudo abarcan una amplia gama de categorías, como péptidos antifúngicos, antibacterianos y antituberculosos.

dbAMP: [75] Proporciona una plataforma en línea para explorar péptidos antimicrobianos con actividades funcionales y propiedades fisicoquímicas en datos de transcriptomas y proteomas. dbAMP es un recurso en línea que aborda diversos temas, como anotaciones de péptidos antimicrobianos (AMP), incluida información de secuencia, actividades antimicrobianas, modificaciones postraduccionales (PTM), visualización estructural, potencia antimicrobiana, especies objetivo con concentración inhibidora mínima (MIC), fisicoquímicas. propiedades o interacciones AMP-proteína. [ cita necesaria ]

Herramientas como PeptideRanker, [76] PeptideLocator, [77] y AntiMPmod [78] [79] permiten la predicción de péptidos antimicrobianos, mientras que se han desarrollado otras para predecir actividades antifúngicas y antituberculosas. [80] [81]

Ver también

Referencias

  1. ^ Ageitos JM, Sánchez-Pérez A, Calo-Mata P, Villa TG (junio de 2017). "Péptidos antimicrobianos (AMP): compuestos antiguos que representan nuevas armas en la lucha contra las bacterias". Farmacología Bioquímica . 133 (6): 117-138. doi :10.1016/j.bcp.2016.09.018. PMID  27663838.
  2. ^ ab Reddy KV, Yedery RD, Aranha C (diciembre de 2004). "Péptidos antimicrobianos: premisas y promesas". Revista internacional de agentes antimicrobianos . 24 (6): 536–547. doi :10.1016/j.ijantimicag.2004.09.005. PMID  15555874.
  3. ^ ab Yeaman MR, Yount NY (marzo de 2003). "Mecanismos de acción y resistencia de péptidos antimicrobianos". Revisiones farmacológicas . 55 (1): 27–55. doi :10.1124/pr.55.1.2. PMID  12615953. S2CID  6731487.
  4. ^ Papagianni M (septiembre de 2003). "Péptidos sintetizados ribosomalmente con propiedades antimicrobianas: biosíntesis, estructura, función y aplicaciones". Avances de la biotecnología . 21 (6): 465–499. doi :10.1016/S0734-9750(03)00077-6. PMID  14499150.
  5. ^ Sitaram N, Nagaraj R (2002). "Péptidos antimicrobianos de defensa del huésped: importancia de la estructura para la actividad". Diseño farmacéutico actual . 8 (9): 727–742. doi :10.2174/1381612023395358. PMID  11945168.
  6. ^ Dürr UH, Sudheendra US, Ramamoorthy A (septiembre de 2006). "LL-37, el único miembro humano de la familia de péptidos antimicrobianos catelicidinas". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1758 (9): 1408-1425. doi : 10.1016/j.bbamem.2006.03.030 . PMID  16716248.
  7. ^ Dhople V, Krukemeyer A, Ramamoorthy A (septiembre de 2006). "La beta-defensina-3 humana, un péptido antibacteriano con múltiples funciones biológicas". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1758 (9): 1499-1512. doi :10.1016/j.bbamem.2006.07.007. PMID  16978580. S2CID  36461159.
  8. ^ Hancock RE, Rozek A (enero de 2002). "Papel de las membranas en las actividades de los péptidos catiónicos antimicrobianos". Cartas de microbiología FEMS . 206 (2): 143-149. doi : 10.1111/j.1574-6968.2002.tb11000.x . PMID  11814654.
  9. ^ Varkey J, Singh S, Nagaraj R (noviembre de 2006). "Actividad antibacteriana de péptidos lineales que abarcan el dominio de hoja beta carboxi-terminal de las defensinas de artrópodos". Péptidos . 27 (11): 2614–2623. doi :10.1016/j.peptides.2006.06.010. PMID  16914230. S2CID  21104756.
  10. ^ ab Nguyen LT, Haney EF, Vogel HJ (septiembre de 2011). "El alcance cada vez mayor de las estructuras peptídicas antimicrobianas y sus modos de acción". Tendencias en Biotecnología . 29 (9): 464–472. doi :10.1016/j.tibtech.2011.05.001. PMID  21680034.
  11. ^ ab O'Driscoll NH, Labovitiadi O, Cushnie TP, Matthews KH, Mercer DK, Lamb AJ (marzo de 2013). "Producción y evaluación de una formulación de oblea que contiene péptidos antimicrobianos para aplicación tópica". Microbiología actual . 66 (3): 271–278. doi :10.1007/s00284-012-0268-3. PMID  23183933. S2CID  18671683.
  12. ^ Hein KZ, Takahashi H, Tsumori T, Yasui Y, Nanjoh Y, Toga T, et al. (octubre de 2015). "La psoriasina reducida en disulfuro es un fungicida de amplio espectro inductor de apoptosis humana". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (42): 13039–13044. Código Bib : 2015PNAS..11213039H. doi : 10.1073/pnas.1511197112 . PMC 4620902 . PMID  26438863. 
  13. ^ abc Brogden KA (marzo de 2005). "Péptidos antimicrobianos: ¿formadores de poros o inhibidores metabólicos en bacterias?". Reseñas de la naturaleza. Microbiología . 3 (3): 238–250. doi :10.1038/nrmicro1098. PMID  15703760. S2CID  23625167.
  14. ^ Hirst DJ, Lee TH, Swann MJ, Unabia S, Park Y, Hahm KS, Aguilar MI (abril de 2011). "Efecto de la estructura de la cadena de acilo y el estado de la fase bicapa sobre la unión y penetración de una bicapa lipídica soportada por HPA3". Revista Europea de Biofísica . 40 (4): 503–514. doi :10.1007/s00249-010-0664-1. PMID  21222117. S2CID  22514308.
  15. ^ Lee TH, Heng C, Swann MJ, Gehman JD, Separovic F, Aguilar MI (octubre de 2010). "Análisis cuantitativo en tiempo real de la alteración de los lípidos por la aureína 1.2 durante la adsorción, desestabilización y lisis de la membrana". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1798 (10): 1977–1986. doi : 10.1016/j.bbamem.2010.06.023 . PMID  20599687.
  16. ^ Turnidge JD, Bell JM (1996). "Pruebas de susceptibilidad de antimicrobianos en medios líquidos". En Lorian V (ed.). Antibióticos en medicina de laboratorio (4ª ed.). Baltimore, Maryland: Williams y Wilkins. págs. 52-111. ISBN 978-0-683-05169-8. Comité Nacional de Normas y Seguridad de Laboratorios (NCLSS)
  17. ^ Wang CK, Shih LY, Chang KY (noviembre de 2017). "El análisis a gran escala de las actividades antimicrobianas en relación con la anfipaticidad y la carga revela una nueva caracterización de los péptidos antimicrobianos". Moléculas . 22 (11): 2037. doi : 10,3390/moléculas22112037 . PMC 6150348 . PMID  29165350. 
  18. ^ Hunter HN, Fulton DB, Ganz T, Vogel HJ (octubre de 2002). "La estructura de la solución de hepcidina humana, una hormona peptídica con actividad antimicrobiana que participa en la absorción de hierro y la hemocromatosis hereditaria". La Revista de Química Biológica . 277 (40): 37597–37603. doi : 10.1074/jbc.M205305200 . PMID  12138110.
  19. ^ Kudrimoti M, Curtis A, Azawi S, Worden F, Katz S, Adkins D, et al. (Diciembre de 2016). "Dusquetide: un nuevo regulador de defensa innato que demuestra una reducción significativa y consistente en la duración de la mucositis oral en datos preclínicos y un estudio clínico de fase 2a aleatorizado y controlado con placebo". Revista de Biotecnología . 239 : 115-125. doi : 10.1016/j.jbiotec.2016.10.010 . PMID  27746305.
  20. ^ ab Guilhelmelli F, Vilela N, Albuquerque P, Derengowski L, Silva-Pereira I, Kyaw CM (diciembre de 2013). "Desafíos del desarrollo de antibióticos: los diversos mecanismos de acción de los péptidos antimicrobianos y de resistencia bacteriana". Fronteras en Microbiología . 4 (4): 353. doi : 10.3389/fmicb.2013.00353 . PMC 3856679 . PMID  24367355. 
  21. ^ Sengupta D, Leontiadou H, Mark AE, Marrink S (1 de octubre de 2008). "Los poros toroidales formados por péptidos antimicrobianos muestran un desorden significativo". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1778 (10): 2308–2317. doi : 10.1016/j.bbamem.2008.06.007 . ISSN  0005-2736. PMID  18602889. S2CID  19387026.
  22. ^ Balatti GE, Martini MF, Pickholz M (17 de julio de 2018). "Un enfoque general para estudiar las interacciones de los péptidos antimicrobianos aureína 1.2 y maculatina 1.1 con mezclas de lípidos POPG / POPE". Revista de modelado molecular . 24 (8): 208. doi :10.1007/s00894-018-3747-z. ISSN  0948-5023. PMID  30019106. S2CID  51678964.
  23. ^ Hallock KJ, Lee DK, Ramamoorthy A (mayo de 2003). "MSI-78, un análogo de los péptidos antimicrobianos magainina, altera la estructura de la bicapa lipídica mediante una tensión de curvatura positiva". Revista Biofísica . 84 (5): 3052–3060. Código Bib : 2003BpJ....84.3052H. doi : 10.1016/S0006-3495(03)70031-9 . PMC 1302867 . PMID  12719236. 
  24. ^ Henzler Wildman KA, Lee DK, Ramamoorthy A (junio de 2003). "Mecanismo de alteración de la bicapa lipídica por el péptido antimicrobiano humano, LL-37". Bioquímica . 42 (21): 6545–6558. doi :10.1021/bi0273563. PMID  12767238.
  25. ^ Järvå M, Lay FT, Phan TK, Humble C, Poon IK, Bleackley MR, et al. (mayo de 2018). "Estructura de rayos X de un complejo antimicrobiano de disrupción de la membrana defensina-fosfolípido similar a una alfombra". Comunicaciones de la naturaleza . 9 (1): 1962. Código bibliográfico : 2018NatCo...9.1962J. doi : 10.1038/s41467-018-04434-y . PMC 5958116 . PMID  29773800. 
  26. ^ Poon IK, Baxter AA, Lay FT, Mills GD, Adda CG, Payne JA, et al. (Abril de 2014). "La oligomerización de una defensina mediada por fosfoinositida induce la lisis celular". eVida . 3 : e01808. doi : 10.7554/elife.01808 . PMC 3968744 . PMID  24692446. 
  27. ^ Järvå M, Phan TK, Lay FT, Caria S, Kvansakul M, Hulett MD (julio de 2018). "La β-defensina 2 humana mata a Candida albicans mediante la permeabilización de la membrana mediada por fosfatidilinositol 4,5-bifosfato". Avances científicos . 4 (7): comer0979. Código Bib : 2018SciA....4..979J. doi : 10.1126/sciadv.aat0979 . PMC 6059731 . PMID  30050988. 
  28. ^ Balatti GE, Ambroggio EE, Fidelio GD, Martini MF, Pickholz M (octubre de 2017). "Interacción diferencial de péptidos antimicrobianos con estructuras lipídicas estudiadas mediante simulaciones de dinámica molecular de grano grueso". Moléculas . 22 (10): 1775. doi : 10,3390/moléculas22101775 . PMC 6151434 . PMID  29053635. 
  29. ^ Gomes B, Augusto MT, Felício MR, Hollmann A, Franco OL, Gonçalves S, Santos NC (9 de enero de 2018). "Diseño de péptidos activos mejorados para enfoques terapéuticos contra enfermedades infecciosas". Avances de la biotecnología . 36 (2): 415–429. doi :10.1016/j.biotechadv.2018.01.004. PMID  29330093. S2CID  3873934.
  30. ^ Hanson MA, Lemaitre B (febrero de 2020). "Nuevos conocimientos sobre la función del péptido antimicrobiano de Drosophila en la defensa del huésped y más allá". Opinión actual en inmunología . 62 : 22–30. doi : 10.1016/j.coi.2019.11.008 . hdl : 10871/133705 . PMID  31835066.
  31. ^ Mookherjee N, Anderson MA, Haagsman HP, Davidson DJ (mayo de 2020). "Péptidos antimicrobianos de defensa del huésped: funciones y potencial clínico" (PDF) . Reseñas de la naturaleza. Descubrimiento de medicamento . 19 (5): 311–332. doi :10.1038/s41573-019-0058-8. hdl : 20.500.11820/1ec38809-e8f2-4684-8bbb-e908ecb5c66e . PMID  32107480. S2CID  211526624.
  32. ^ ab Hoskin DW, Ramamoorthy A (febrero de 2008). "Estudios sobre las actividades anticancerígenas de los péptidos antimicrobianos". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1778 (2): 357–375. doi :10.1016/j.bbamem.2007.11.008. PMC 2238813 . PMID  18078805. 
  33. ^ Parvy JP, Yu Y, Dostalova A, Kondo S, Kurjan A, Bulet P, et al. (julio de 2019). "El péptido antimicrobiano defensina coopera con el factor de necrosis tumoral para impulsar la muerte de las células tumorales en Drosophila". eVida . 8 . doi : 10.7554/eLife.45061 . PMC 6667213 . PMID  31358113. 
  34. ^ Kalsy M, Tonk M, Hardt M, Dobrindt U, Zdybicka-Barabas A, Cytrynska M, et al. (febrero de 2020). "El péptido antimicrobiano de insectos cecropina A altera las biopelículas uropatógenas de Escherichia coli". npj Biopelículas y microbiomas . 6 (1): 6.doi : 10.1038 /s41522-020-0116-3 . PMC 7016129 . PMID  32051417. 
  35. ^ Hassan M, Kjos M, Nes IF, Diep DB, Lotfipour F (octubre de 2012). "Péptidos antimicrobianos naturales de bacterias: características y posibles aplicaciones para luchar contra la resistencia a los antibióticos". Revista de Microbiología Aplicada . 113 (4): 723–736. doi :10.1111/j.1365-2672.2012.05338.x. PMID  22583565. S2CID  19503463.
  36. ^ Kumaresan V, Bhatt P, Ganesh MR, Harikrishnan R, Arasu M, Al-Dhabi NA, et al. (Diciembre de 2015). "Un nuevo péptido antimicrobiano derivado de la lisozima de tipo ganso de pescado altera la membrana de Salmonella enterica". Inmunología molecular . 68 (2 partes B): 421–433. doi :10.1016/j.molimm.2015.10.001. PMID  26477736.
  37. ^ Arasu A, Kumaresan V, Ganesh MR, Pasupuleti M, Arasu MV, Al-Dhabi NA, Arockiaraj J (junio de 2017). "Actividad bactericida del péptido de unión a membrana derivado de galectina 4 de pescado marcado con oligotriptófano". Inmunología comparada y del desarrollo . 71 : 37–48. doi :10.1016/j.dci.2017.01.019. PMID  28126555. S2CID  22374102.
  38. ^ Arockiaraj J, Chaurasia MK, Kumaresan V, Palanisamy R, Harikrishnan R, Pasupuleti M, Kasi M (abril de 2015). "Lectina de unión a manosa de Macrobrachium rosenbergii: síntesis de los péptidos MrMBL-N20 ​​y MrMBL-C16 y su caracterización antimicrobiana, bioinformática y análisis de expresión génica relativa". Inmunología de pescados y mariscos . 43 (2): 364–374. doi :10.1016/j.fsi.2014.12.036. PMID  25575476.
  39. ^ Somasekhar M (24 de abril de 2019). «En el oso hormiguero la leche podría ser una alternativa a los antibióticos» . Línea de negocios . Chennai, India: Kasturi & Sons Ltd. Consultado el 17 de enero de 2021 .
  40. ^ "La leche de mamíferos ponedores de huevos puede ayudar con nuevos antibióticos". Heraldo de Deccan . India: Las imprentas Mysore. Confianza de prensa de la India. 25 de abril de 2019 . Consultado el 17 de enero de 2021 .
  41. ^ ab Matsuzaki K (agosto de 2009). "Control de la selectividad celular de péptidos antimicrobianos". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas (Artículo de revisión). 1788 (8): 1687–1692. doi :10.1016/j.bbamem.2008.09.013. PMID  18952049.
  42. ^ Sawaki K, Mizukawa N, Yamaai T, Yoshimoto T, Nakano M, Sugahara T (2002). "Alta concentración de beta-defensina-2 en el carcinoma oral de células escamosas". Investigación contra el cáncer . 22 (4): 2103–2107. PMID  12174890.
  43. ^ Kida-Takaoka S, Yamaai T, Mizukawa N, Murakami J, Iida S (noviembre de 2014). "Las células circundantes afectan el patrón de expresión genética de las beta-defensinas humanas en el carcinoma de células escamosas in vitro". Investigación contra el cáncer . 34 (11): 6443–6449. PMID  25368244 . Consultado el 7 de febrero de 2019 .
  44. ^ ab Hancock RE, Sahl HG (diciembre de 2006). "Péptidos antimicrobianos y de defensa del huésped como nuevas estrategias terapéuticas antiinfecciosas". Nature Biotechnology (artículo de revisión). 24 (12): 1551-1557. doi :10.1038/nbt1267. PMID  17160061. S2CID  22384207.
  45. ^ Zhang L, Xie J (septiembre de 2023). "Biosíntesis, estructura y función biológica del glucósido de colesterol en Helicobacter pylori: una revisión". Medicina (Baltimore) . 102 (36): e34911. doi :10.1097/MD.0000000000034911. PMC 10489377 . PMID  37682174. 
  46. ^ ab Zasloff M (enero de 2002). "Péptidos antimicrobianos de organismos multicelulares". Naturaleza (Artículo de revisión). 415 (6870): 389–395. Código Bib :2002Natur.415..389Z. doi :10.1038/415389a. PMID  11807545. S2CID  205028607.
  47. ^ ab Matsuzaki K, Sugishita K, Fujii N, Miyajima K (marzo de 1995). "Base molecular de la selectividad de membrana de un péptido antimicrobiano, magainina 2". Bioquímica . 34 (10): 3423–3429. doi :10.1021/bi00010a034. PMID  7533538.
  48. ^ Chou HT, Kuo TY, Chiang JC, Pei MJ, Yang WT, Yu HC y otros. (Agosto de 2008). "Diseño y síntesis de péptidos antimicrobianos catiónicos con actividad y selectividad mejoradas frente a Vibrio spp". Revista internacional de agentes antimicrobianos . 32 (2): 130-138. doi :10.1016/j.ijantimicag.2008.04.003. PMID  18586467.
  49. ^ Tennessen JA (noviembre de 2005). "Evolución molecular de péptidos antimicrobianos animales: selección positiva moderada generalizada". Journal of Evolutionary Biology (artículo de revisión). 18 (6): 1387-1394. doi : 10.1111/j.1420-9101.2005.00925.x . PMID  16313451.
  50. ^ Yu L, Guo L, Ding JL, Ho B, Feng SS, Popplewell J, et al. (febrero de 2009). "Interacción de un péptido antimicrobiano artificial con membranas lipídicas". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1788 (2): 333–344. doi :10.1016/j.bbamem.2008.10.005. PMID  19013127.
  51. ^ Lee TH, Hall K, Mechler A, Martin L, Popplewell J, Ronan G, Aguilar MI (2009). "Imágenes moleculares y cambios de orientación de péptidos antimicrobianos en membranas". Péptidos para la juventud . Avances en Medicina y Biología Experimentales. vol. 611, págs. 313–315. Código bibliográfico : 2009peyo.book..313L. doi :10.1007/978-0-387-73657-0_140. ISBN 978-0-387-73656-3. PMID  19400207.
  52. ^ Zhu WL, Lan H, Park Y, Yang ST, Kim JI, Park IS, et al. (octubre de 2006). "Efectos de la sustitución de residuos peptoides Pro -> sobre la selectividad celular y el mecanismo de acción antibacteriana del péptido antimicrobiano tritripticinamida". Bioquímica . 45 (43): 13007–13017. doi :10.1021/bi060487+. PMID  17059217.
  53. ^ Kulagina NV, Lassman ME, Ligler FS, Taitt CR (octubre de 2005). "Péptidos antimicrobianos para la detección de bacterias en ensayos de biosensores". Química analítica . 77 (19): 6504–6508. doi :10.1021/ac050639r. PMID  16194120.
  54. ^ ab Peschel A, Otto M, Jack RW, Kalbacher H, Jung G, Götz F (marzo de 1999). "La inactivación del operón dlt en Staphylococcus aureus confiere sensibilidad a las defensinas, protegrinas y otros péptidos antimicrobianos". La Revista de Química Biológica . 274 (13): 8405–8410. doi : 10.1074/jbc.274.13.8405 . PMID  10085071.
  55. ^ Campos MA, Vargas MA, Regueiro V, Llompart CM, Albertí S, Bengoechea JA (diciembre de 2004). Weiser JN (ed.). "El polisacárido de la cápsula media la resistencia bacteriana a los péptidos antimicrobianos". Infección e inmunidad . 72 (12): 7107–7114. doi :10.1128/IAI.72.12.7107-7114.2004. PMC 529140 . PMID  15557634. 
  56. ^ China B, N'Guyen BT, de Bruyere M, Cornelis GR (abril de 1994). "Papel de YadA en la resistencia de Yersinia enterocolitica a la fagocitosis por leucocitos polimorfonucleares humanos". Infección e inmunidad . 62 (4): 1275-1281. doi :10.1128/IAI.62.4.1275-1281.1994. PMC 186269 . PMID  8132334. 
  57. ^ Shelton CL, Raffel FK, Beatty WL, Johnson SM, Mason KM (noviembre de 2011). "Importación mediada por transportador de savia y posterior degradación de péptidos antimicrobianos en Haemophilus". Más patógenos . 7 (11): e1002360. doi : 10.1371/journal.ppat.1002360 . PMC 3207918 . PMID  22072973. 
  58. ^ Nikaido H (octubre de 1996). "Bombas de eflujo de múltiples fármacos de bacterias gramnegativas". Revista de Bacteriología . 178 (20): 5853–5859. doi :10.1128/jb.178.20.5853-5859.1996. PMC 178438 . PMID  8830678. 
  59. ^ Whitelock JM, Murdoch AD, Iozzo RV, Underwood PA (abril de 1996). "La degradación del perlecano derivado de células endoteliales humanas y la liberación del factor de crecimiento de fibroblastos básico unido por estromelisina, colagenasa, plasmina y heparanasas". La Revista de Química Biológica . 271 (17): 10079–10086. doi : 10.1074/jbc.271.17.10079 . PMID  8626565.
  60. ^ Kulkarni HM, Swamy C, Jagannadham MV (marzo de 2014). "La caracterización molecular y el análisis funcional de las vesículas de la membrana externa de la bacteria antártica Pseudomonas syringae sugieren una posible respuesta a las condiciones ambientales". Revista de investigación del proteoma . 13 (3): 1345-1358. doi :10.1021/pr4009223. PMID  24437924.
  61. ^ Chua SL, Tan SY, Rybtke MT, Chen Y, Rice SA, Kjelleberg S, et al. (Mayo 2013). "El GMP dimérico bis-(3'-5')-cíclico regula la resistencia a los péptidos antimicrobianos en Pseudomonas aeruginosa". Agentes antimicrobianos y quimioterapia . 57 (5): 2066-2075. doi :10.1128/AAC.02499-12. PMC 3632963 . PMID  23403434. 
  62. ^ Habets MG, Brockhurst MA (junio de 2012). "Los péptidos antimicrobianos terapéuticos pueden comprometer la inmunidad natural". Cartas de biología . 8 (3): 416–418. doi :10.1098/rsbl.2011.1203. PMC 3367763 . PMID  22279153. 
  63. ^ Bahar AA, Ren D (noviembre de 2013). "Péptidos antimicrobianos". Productos farmacéuticos . 6 (12): 1543-1575. doi : 10.3390/ph6121543 . PMC 3873676 . PMID  24287494. 
  64. ^ Gumienna-Kontecka E, Carver PL (2019). "Capítulo 7. Construcción de un caballo de Troya: conjugados sideróforo-fármaco para el tratamiento de enfermedades infecciosas". En Sigel A, Freisinger E, Sigel RK, Carver PL (eds.). Metales esenciales en medicina: uso terapéutico y toxicidad de los iones metálicos en la clínica . vol. 19. Berlín: de Gruyter GmbH. págs. 181-202. doi :10.1515/9783110527872-013. ISBN 978-3-11-052691-2. PMID  30855108. S2CID  73727689. {{cite book}}: |journal=ignorado ( ayuda )
  65. ^ "Péptidos antimicrobianos de insectos OPM". Base de datos de orientaciones de proteínas en membranas (OPM) .
  66. ^ Szymanowski F, Balatti GE, Ambroggio E, Hugo AA, Martini MF, Fidelio GD, et al. (junio de 2019). "Actividad diferencial de péptidos líticos α-helicoidales sobre lactobacilos y liposomas derivados de lactobacilos". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1861 (6): 1069-1077. doi : 10.1016/j.bbamem.2019.03.004 . PMID  30878358.
  67. ^ "Péptidos antimicrobianos de anfibios". Base de datos de orientaciones de proteínas en membranas (OPM) .
  68. ^ Yang M, Zhang C, Zhang X, Zhang MZ, Rottinghaus GE, Zhang S (septiembre de 2016). "Análisis de estructura-función de β-defensina-6 y β-defensina-12 aviar: papel de la carga y los puentes disulfuro". Microbiología BMC . 16 (1): 210. doi : 10.1186/s12866-016-0828-y . PMC 5016922 . PMID  27613063. 
  69. ^ Niedermaier H (9 de febrero de 2012). "Imitadores sintéticos de péptidos antimicrobianos: una nueva ola de antibióticos". Departamento de Química . Universidad de Georgia. Archivado desde el original el 28 de octubre de 2016 . Consultado el 27 de octubre de 2016 .
  70. ^ Kohn EM, Shirley DJ, Arotsky L, Picciano AM, Ridgway Z, Urban MW y otros. (febrero de 2018). "Papel de las cadenas laterales catiónicas en la actividad antimicrobiana del C18G". Moléculas . 23 (2): 329. doi : 10,3390/moléculas23020329 . PMC 6017431 . PMID  29401708. 
  71. ^ Shin JM, Gwak JW, Kamarajan P, Fenno JC, Rickard AH, Kapila YL (junio de 2016). "Aplicaciones biomédicas de la nisina". Revista de Microbiología Aplicada . 120 (6): 1449-1465. doi :10.1111/jam.13033. PMC 4866897 . PMID  26678028. 
  72. ^ Lee HT, Lee CC, Yang JR, Lai JZ, Chang KY (febrero de 2015). "Una clasificación estructural a gran escala de péptidos antimicrobianos". Investigación BioMed Internacional . 2015 : 475062. doi : 10.1155/2015/475062 . PMC 4426897 . PMID  26000295. 
  73. ^ Waghu FH, Gopi L, Barai RS, Ramteke P, Nizami B, Idicula-Thomas S (enero de 2014). "CAMP: Colección de secuencias y estructuras de péptidos antimicrobianos". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de la base de datos): D1154 – D1158. doi : 10.1093/nar/gkt1157. PMC 3964954 . PMID  24265220. 
  74. ^ Shi GB, Kang XY, Dong FY, Liu YC, Zhu N (enero de 2022). "DRAMP 3.0: un depósito de datos completo mejorado de péptidos antimicrobianos". Investigación de ácidos nucleicos . 50 (Problema de la base de datos): D488–D496. doi : 10.1093/nar/gkab651. PMC 8728287 . PMID  34390348. 
  75. ^ Jhong JH, Chi YH, Li WC, Lin TH, Huang KY, Lee TY (enero de 2019). "dbAMP: un recurso integrado para explorar péptidos antimicrobianos con actividades funcionales y propiedades fisicoquímicas en datos de transcriptoma y proteoma". Investigación de ácidos nucleicos . 47 (D1): D285-D297. doi : 10.1093/nar/gky1030. PMC 6323920 . PMID  30380085. 
  76. ^ Mooney C, Haslam NJ, Pollastri G, Shields DC (8 de octubre de 2012). "Hacia el mejor descubrimiento y diseño de péptidos funcionales: las características comunes de diversas clases permiten la predicción generalizada de la bioactividad". MÁS UNO . 7 (10): e45012. Código Bib : 2012PLoSO...745012M. doi : 10.1371/journal.pone.0045012 . PMC 3466233 . PMID  23056189. 
  77. ^ Mooney C, Haslam NJ, Holton TA, Pollastri G, Shields DC (mayo de 2013). "PeptideLocator: predicción de péptidos bioactivos en secuencias de proteínas". Bioinformática . 29 (9): 1120-1126. doi : 10.1093/bioinformática/btt103 . hdl : 10197/10121 . PMID  23505299.
  78. ^ Müller AT, Gabernet G, Hiss JA, Schneider G (septiembre de 2017). "modlAMP: Python para péptidos antimicrobianos". Bioinformática . 33 (17): 2753–2755. doi : 10.1093/bioinformática/btx285 . hdl : 20.500.11850/206770 . PMID  28472272.
  79. ^ Agrawal P, GP de Raghava (26 de octubre de 2018). "Predicción del potencial antimicrobiano de un péptido modificado químicamente a partir de su estructura terciaria". Fronteras en Microbiología . 9 : 2551. doi : 10.3389/fmicb.2018.02551 . PMC 6212470 . PMID  30416494. 
  80. ^ Agrawal P, Bhalla S, Chaudhary K, Kumar R, Sharma M, Raghava GP (26 de febrero de 2018). "Enfoque in silico para la predicción de péptidos antifúngicos". Fronteras en Microbiología . 9 : 323. doi : 10.3389/fmicb.2018.00323 . PMC 5834480 . PMID  29535692. 
  81. ^ Usmani SS, Bhalla S, Raghava GP (26 de agosto de 2018). "Predicción de péptidos antituberculosos a partir de información de secuencia utilizando clasificador de conjunto y características híbridas". Fronteras en Farmacología . 9 : 954. doi : 10.3389/ffhar.2018.00954 . PMC 6121089 . PMID  30210341. 

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