cromosoma humano
El cromosoma 5 es uno de los 23 pares de cromosomas de los humanos . Las personas normalmente tienen dos copias de este cromosoma. El cromosoma 5 abarca alrededor de 182 millones de pares de bases (los componentes básicos del ADN ) y representa casi el 6% del ADN total de las células . El cromosoma 5 es el quinto cromosoma humano más grande, pero tiene una de las densidades genéticas más bajas . Esto se explica en parte por numerosas regiones pobres en genes que muestran un grado notable de conservación sinténica y no codificante con vertebrados no mamíferos , lo que sugiere que están funcionalmente limitadas. [4]
Debido a que el cromosoma 5 es responsable de muchas formas de crecimiento y desarrollo ( divisiones celulares ), los cambios pueden causar cáncer . Un ejemplo sería la leucemia mieloide aguda (AML). [5]
genes
Número de genes
Las siguientes son algunas de las estimaciones del recuento de genes del cromosoma 5 humano. Debido a que los investigadores utilizan diferentes enfoques para la anotación del genoma, sus predicciones sobre la cantidad de genes en cada cromosoma varían (para obtener detalles técnicos, consulte predicción de genes ). Entre varios proyectos, el proyecto colaborativo de secuencia de codificación por consenso ( CCDS ) adopta una estrategia extremadamente conservadora. Por lo tanto, la predicción del número de genes del CCDS representa un límite inferior en el número total de genes que codifican proteínas humanas. [6]
lista de genes
La siguiente es una lista parcial de genes en el cromosoma 5 humano. Para obtener una lista completa, consulte el enlace en el cuadro de información a la derecha.
- ABLIM3 : proteína codificante Proteína LIM 3 de unión a actina
- ADAMTS2 : metalopeptidasa ADAM con motivo de trombospondina tipo 1, 2
- AGXT2 : Alanina-glioxilato aminotransferasa 2
- ANKRD31 : proteína codificante del dominio repetido 31 de Ankyrin
- APBB3 : proteína codificante miembro 3 de la familia B de unión a proteínas precursoras de amiloide beta A4
- APC : adenomatosis poliposis coli
- ARL15 : proteína codificante similar al factor de ribosilación ADP 15
- BRIX1 : homólogo BRX1 de la proteína de biogénesis del ribosoma (también BXDC2)
- C1QTNF3 : proteína 3 relacionada con el factor de necrosis tumoral C1q del complemento
- C5orf45 : marco de lectura abierto del cromosoma 5 45
- C5orf47 : proteína codificante Cromosoma 5 marco de lectura abierto 47
- C5orf49 : proteína codificante Cromosoma 5 marco de lectura abierto 49
- ELENCO : Calpastatina
- CDO1 : proteína codificante cisteína dioxigenasa tipo 1
- CPLANE1 : Ciliogénesis y efector de polaridad plana 1
- CPLX2 : Complexina-2
- CREBRF : proteína codificante del factor regulador CREB3
- CXXC5 : proteína zing finger tipo CXXC 5
- DPYSL3 : proteína 3 similar a la dihidropirimidinasa
- EGR1 : proteína 1 de respuesta al crecimiento temprano
- ERAP1 : aminopeptidasa 1 del retículo endoplásmico (anteriormente llamada ARTS-1 )
- ERAP2 : aminopeptidasa 2 del retículo endoplásmico
- ESM1 : molécula 1 específica de células endoteliales
- DTDST : transportador de sulfato de displasia diastrófica
- EIF4E1B : proteína codificante del factor 4E de iniciación de la traducción eucariótica, miembro 1B de la familia
- ERCC8 : reparación por escisión, deficiencia de reparación de roedores con complementación cruzada, grupo de complementación 8
- FAF2 : proteína codificante miembro 2 de la familia del factor asociado a Fas
- FAM172A : proteína codificante UPF0528 proteína FAM172A
- FAM105B : familia de proteínas codificantes con similitud de secuencia 105, miembro B
- FAM114A2 : proteína codificante FAM114A2
- FAM71B : familia de proteínas codificantes con similitud de secuencia 71 miembro B
- FASTKD3 : proteína 3 que contiene el dominio FAST quinasa
- FBXL7 : proteína 7 de repetición F-box/LRR
- FCHSD1 : FCH y proteína 1 de doble dominio SH3
- FGF1 : factor de crecimiento de fibroblastos 1 (factor de crecimiento de fibroblastos ácido)
- FGFR4 : receptor 4 del factor de crecimiento de fibroblastos
- GM2A : activador del gangliósido GM2
- GNPDA1 : Glucosamina-6-fosfato isomerasa 1
- GPBP1 : Vasculina
- HEXB : hexosaminidasa B (polipéptido beta)
- HMGXB3 : proteína codificante HMG-box que contiene 3
- IK : Proteína Roja
- IRX1 : proteína homeodominio de clase iroquesa (humana)
- LARP1 : proteína 1 relacionada con La
- LMAN2 : unión lectina manosa 2
- LNCR3 que codifica la proteína Susceptibilidad al cáncer de pulmón 3
- LPCAT1 : lisofosfatidilcolina aciltransferasa 1
- LYRM7 : motivo LYR de proteína codificante que contiene 7
- LYSMD3 : LysM y proteína 3 que contiene el dominio de unión de peptidoglicano putativo
- MAN2A1 : Alfa-manosidasa 2
- MASS1: homólogo 1 de susceptibilidad a convulsiones monogénica y audiogénica (ratón)
- MCC : proteína del cáncer colorrectal mutante
- MCCC2 : metilcrotonoil-coenzima A carboxilasa 2 (beta)
- MCEF : factor de transcripción familia AF4/FMR2, miembro 4
- MEF2C : factor potenciador 2C específico de miocitos
- MEF2C-AS1 : proteína codificante ARN 1 antisentido MEF2C
- MGAT1 : manosil (alfa-1,3-)-glicoproteína beta-1,2-N-acetilglucosaminiltransferasa
- MINAR2 : proteína codificante similar a Kiaa1024
- MIR1271 : codifica el microARN 1271
- MIR146A : microARN 146a
- MTRR : 5-metiltetrahidrofolato-homocisteína metiltransferasa reductasa
- MZB1 : Proteína específica de células de la zona marginal B y B1
- NIPBL : Homólogo Nipped-B (Drosophila)
- NREP : Proteína relacionada con la regeneración neuronal
- NSA2 que codifica la proteína TGF proteína nuclear inducible beta 1
- NSD1 : proteína correguladora de la transcripción
- NSUN2 : NOP2/familia de dominios Sun, miembro 2
- NR2F1 : receptor hormonal nuclear
- NSG2 : proteína codificante de la proteína Hmp19
- NUDCD2 : proteína 2 que contiene el dominio NudC
- P4HA2 : Subunidad alfa-2 de prolil 4-hidroxilasa
- PCBD2 : Pterin-4-alfa-carbinolamina deshidratasa 2
- PELO : Homólogo de pelota
- PGGT1B : proteína codificante Proteína geranilgeraniltransferasa tipo I subunidad beta
- PHAX : Adaptador fosforilado para exportación de ARN
- Pikachurin : Responsable del funcionamiento de las sinapsis de la cinta ; permite al ojo seguir objetos en movimiento
- PFDN1 : subunidad 1 de preplegado
- POLR3G : codifica la proteína polimerasa (ARN) III (dirigida por ADN) polipéptido G (32 kD)
- PPIP5K2 : difosfoinositol pentaquisfosfato quinasa 2
- PRCC1 : bobina enrollada rica en prolina 1
- PRR16 : proteína codificante Proteína 16 rica en prolina
- PURA : Proteína A de unión a elementos rica en purinas
- PWWP2A : proteína codificante del dominio PWWP que contiene 2A
- RANBP3L : proteína codificante similar a la proteína 3 de unión a RAN
- RASGEF1C : proteína codificante miembro 1C de la familia del dominio RasGEF
- RMND5B : Requerido para el homólogo B de la división nuclear meiótica 5
- SFXN1 : Sideroflexina-1
- SKIV2L2 : Ski2 como ARN helicasa 2
- SLC22A5 : familia de transportadores de solutos 22 (transportador de cationes orgánicos), miembro 5
- SLC26A2 : familia de transportadores de solutos 26 (transportador de sulfatos), miembro 2
- SH3TC2 : dominio y tetratricopéptido repeticiones 2
- SLCO4C1 : miembro de la familia de transportadores de aniones orgánicos portadores de solutos 4c1
- SLU7 : factor de empalme pre-ARNm SLU7
- SMN1 : neurona motora de supervivencia 1, telomérica
- SMN2 : neurona motora de supervivencia 2, centromérica
- SNCAIP : sinucleína, proteína de interacción alfa (sinfilina)
- SPEF2 : proteína flagelar 2 del espermatozoide
- SPINK5 : inhibidor de serina proteasa Kazal tipo 5 (LEKTI)
- SPINK6 : inhibidor de serina proteasa Kazal tipo 6
- SPINK9 : inhibidor de serina proteasa Kazal tipo 9 (LEKTI-2)
- SPZ1 : proteína cremallera de leucina espermatogénica 1
- STC2 : estaniocalcina-2
- TBCA : chaperona A específica de tubulina
- TCOF1 : Síndrome de Treacher Collins-Franceschetti 1
- TGFBI : queratoepitelina
- THG1L : Probable ARNt(His)guanililtransferasa
- TICAM2 : molécula adaptadora 2 que contiene el dominio TIR
- TMEM171 : proteína codificante Proteína transmembrana 171
- TNFAIP8 : factor de necrosis tumoral, proteína 8 inducida por alfa
- TSSK1B : proteína codificante de serina quinasa 1b específica de testículo
- TTC37 : dominio de repetición tetratricopeptídico 37
- UPF0488 : codifica la vía de señalización de la proteína del receptor acoplado a proteína G
- YIPF5 : miembro 5 de la familia del dominio Yip1
- YTHDC2 : proteína codificante del dominio YTH que contiene 2
- ZBED3 : proteína 3 que contiene el dominio BED con dedos de zinc
- ZNF608 : proteína codificante Proteína de dedos de zinc 608
Enfermedades y trastornos
Las siguientes son algunas de las enfermedades relacionadas con genes ubicados en el cromosoma 5:
Condiciones cromosómicas
Las siguientes condiciones son causadas por cambios en la estructura o el número de copias del cromosoma 5:
- El síndrome de Cri-du-chat es causado por una eliminación del extremo del brazo corto (p) del cromosoma 5. Este cambio cromosómico se escribe como 5p-. Los signos y síntomas del síndrome cri-du-chat probablemente estén relacionados con la pérdida de múltiples genes en esta región. Los investigadores no han identificado todos estos genes ni han determinado cómo su pérdida conduce a las características del trastorno. Sin embargo, han descubierto que una eliminación mayor tiende a provocar un retraso mental y retrasos en el desarrollo más graves en personas con síndrome de cri-du-chat. [13] [14] [15]
- Los investigadores han definido regiones estrechas del brazo corto del cromosoma 5 que están asociadas con características particulares del síndrome de cri-du-chat. Una región específica denominada 5p15.3 se asocia con un llanto felino, y una región cercana llamada 5p15.2 se asocia con retraso mental, cabeza pequeña (microcefalia) y rasgos faciales distintivos.
- La poliposis adenomatosa familiar es causada por una eliminación del gen supresor de tumores APC en el brazo largo (q) del cromosoma 5. Este cambio cromosómico da como resultado miles de pólipos colónicos, lo que le da al paciente un riesgo del 100 % de cáncer de colon si no se realiza una colectomía total. hecho.
- El síndrome de deleción del cromosoma 5q es causado por la deleción del brazo q (brazo largo) del cromosoma 5. Esta deleción se ha relacionado con varios trastornos relacionados con la sangre, incluido el síndrome mielodisplásico y la eritroblastopenia . Esta es una condición diferente a Cri-du-chat mencionada anteriormente.
- Otros cambios en el número o la estructura del cromosoma 5 pueden tener diversos efectos, incluido retraso en el crecimiento y desarrollo, rasgos faciales distintivos, defectos de nacimiento y otros problemas médicos. Los cambios en el cromosoma 5 incluyen un segmento adicional del brazo corto (p) o largo (q) del cromosoma en cada célula (trisomía parcial 5p o 5q), un segmento faltante del brazo largo del cromosoma en cada célula (monosomía parcial 5q), y una estructura circular llamada cromosoma 5 en anillo. Un cromosoma en anillo se produce cuando se reúnen ambos extremos de un cromosoma roto.
banda citogenética
Referencias
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Otras lecturas
- Mainardi PC, Perfumo C, Cali A, Coucourde G, Pastore G, Cavani S, et al. (2001). "Caracterización clínica y molecular de 80 pacientes con deleción 5p: correlación genotipo-fenotipo". J Med Genet . 38 (3): 151–8. doi :10.1136/jmg.38.3.151. PMC 1734829 . PMID 11238681.
- Schafer IA, Robin NH, Posch JJ, Clark BA, Izumo S, Schwartz S (2001). "Síndrome de deleción distal 5q: correlaciones fenotípicas". Soy J Med Genet . 103 (1): 63–8. doi :10.1002/ajmg.1513. PMID 11562936.
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enlaces externos
Wikimedia Commons tiene medios relacionados con el cromosoma 5 humano .
- Institutos Nacionales de Salud. "Cromosoma 5". Referencia del hogar de genética . Archivado desde el original el 14 de octubre de 2004 . Consultado el 6 de mayo de 2017 .
- "Cromosoma 5". Archivo de información del Proyecto Genoma Humano 1990-2003 . Consultado el 6 de mayo de 2017 .