Dominio proteico
El dominio de homología de pleckstrina ( dominio PH ) o ( PHIP ) es un dominio proteico de aproximadamente 120 aminoácidos que se encuentra en una amplia gama de proteínas implicadas en la señalización intracelular o como constituyentes del citoesqueleto . [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7]
Este dominio puede unirse a lípidos de fosfatidilinositol dentro de membranas biológicas (como el fosfatidilinositol (3,4,5) -trifosfato y el fosfatidilinositol (4,5) -bifosfato ), [ 8] y proteínas como las subunidades βγ de las proteínas G heterotriméricas . 9] y proteína quinasa C. [10] A través de estas interacciones, los dominios PH desempeñan un papel en el reclutamiento de proteínas para diferentes membranas , dirigiéndolas así a compartimentos celulares apropiados o permitiéndoles interactuar con otros componentes de las vías de transducción de señales .
Especificidad de unión a lípidos
Los dominios PH individuales poseen especificidades para los fosfoinosítidos fosforilados en diferentes sitios dentro del anillo de inositol ; por ejemplo, algunos se unen al fosfatidilinositol (4,5)-bisfosfato pero no al fosfatidilinositol (3,4,5)-trifosfato o al fosfatidilinositol (3,4)-bisfosfato . mientras que otros pueden poseer la afinidad necesaria. Esto es importante porque hace que el reclutamiento de diferentes dominios PH que contienen proteínas sea sensible a las actividades de enzimas que fosforilan o desfosforilan estos sitios en el anillo de inositol, como la fosfoinositida 3-quinasa o PTEN , respectivamente. Por tanto, dichas enzimas ejercen parte de su efecto sobre la función celular modulando la localización de proteínas de señalización posteriores que poseen dominios PH que son capaces de unirse a sus productos fosfolípidos.
Estructura
Se ha determinado la estructura 3D de varios dominios PH. [11] Todos los casos conocidos tienen una estructura común que consiste en dos láminas beta antiparalelas perpendiculares , seguidas de una hélice anfipática C-terminal . Los bucles que conectan las cadenas beta difieren mucho en longitud, lo que hace que el dominio PH sea relativamente difícil de detectar y al mismo tiempo proporciona la fuente de la especificidad del dominio. El único residuo conservado entre los dominios PH es un único triptófano ubicado dentro de la hélice alfa que sirve para nuclear el núcleo del dominio.
Proteínas que contienen dominio PH
Los dominios PH se pueden encontrar en muchas proteínas diferentes, como OSBP o ARF . El reclutamiento en el aparato de Golgi en este caso depende tanto de PtdIns como de ARF. Una gran cantidad de dominios PH tienen poca afinidad por los fosfoinosítidos y se supone que funcionan como dominios de unión a proteínas. Una mirada a todo el genoma en Saccharomyces cerevisiae mostró que la mayoría de los 33 dominios PH de levadura son de hecho promiscuos en la unión a fosfoinosítidos, mientras que solo uno (Num1-PH) se comportó de manera altamente específica. [12] Las proteínas que contienen dominios PH pertenecen a las siguientes familias:
- La pleckstrina , la proteína donde se detectó por primera vez este dominio, es el sustrato principal de la proteína quinasa C en las plaquetas. Pleckstrin contiene dos dominios PH. Las proteínas ARAP contienen cinco dominios PH.
- Proteínas quinasas específicas de serina/treonina como la familia Akt/Rac, la proteína quinasa D1 y la familia tripanosómica NrkA.
- Tirosina quinasas no receptoras pertenecientes a la subfamilia Btk/Itk/Tec.
- Sustrato del receptor de insulina 1 ( IRS-1 ).
- Reguladores de proteínas G pequeñas : 64 RhoGEF de la familia Dbl-like, [13] y varias proteínas activadoras de GTPasa como las proteínas ABR, BCR o ARAP.
- Proteínas citoesqueléticas como dinamina (ver InterPro : IPR001401 ), proteína similar a kinesina de Caenorhabditis elegans unc-104 (ver InterPro : IPR001752 ), cadena beta de espectrina, sintrofina (2 dominios PH) y proteína de migración nuclear NUM1 de S. cerevisiae .
- Proteínas de unión a oxisterol OSBP, S. cerevisiae OSH1 y YHR073w.
- Ceramida quinasa , una lípido quinasa que fosforila las ceramidas a ceramida-1-fosfato. [14]
- Receptor quinasas de proteína G (GRK) de la subfamilia GRK2 (receptores quinasas beta-adrenérgicos): GRK2 y GRK3 . [15]
Subfamilias
Ejemplos
Los genes humanos que codifican proteínas que contienen este dominio incluyen:
- ABR, ADRBK1 , ADRBK2 , AFAP, AFAP1 , AFAP1L1, AFAP1L2, AKAP13 , AKT1 , AKT2 , AKT3 , ANLN , APBB1IP , APPL1 , APPL2 , ARHGAP10 , ARHGAP12, ARHGAP15, ARHGAP21, ARHGAP22, ARHGAP23, 24 , ARHGAP25 , ARHGAP26 , ARHGAP27 , ARHGAP9 , ARHGEF16, ARHGEF18, ARHGEF19, ARHGEF2 , ARHGEF3 , ARHGEF4 , ARHGEF5 , ARHGEF6 , ARHGEF7 , ARHGEF9 , ASEF2,
- BMX , BTK ,
- C20orf42 , C9orf100, CADPS , CADPS2 , CDC42BPA , CDC42BPB, CDC42BPG, CENTA1 , CENTA2 , CENTB1 , CENTB2 , CENTB5 , CENTD1 , CENTD2 , CENTD3 , CENTG1 , CENTG2 , CENTG3 , CERK , CIT , SR1 , CNKSR2 , COL4A3BP , CTGLF1 , CTGLF2, CTGLF3, * CTGLF4, CTGLF5, CTGLF6,
- DAB2IP , DAPP1 , DDEF1 , DDEF2 , DDEFL1, DEF6 , DEPDC2, DGKD , DGKH, DGKK, DNM1 , DNM2 , DNM3 , DOCK10 , DOCK11, DOCK9 , DOK1 , DOK2 , DOK3 , DOK4 , DOK5 , DOK6, DTGCU2,
- EXOC8 ,
- FAM109A, FAM109B, FARP1 , FARP2 , FGD1 , FGD2 , FGD3 , FGD4 , FGD5, FGD6,
- GAB1 , GAB2 , GAB3 , GAB4, GRB10 , GRB14 , GRB7 ,
- IRS1 , IRS2 , IRS4 , ITK , ITSN1 , ITSN2 ,
- KALRN , KIF1A , KIF1B , KIF1Bbeta,
- MCF2 , MCF2L , MCF2L2, MRIP , MYO10 ,
- NET1 , NGEF ,
- OBPH1, OBSCN , OPHN1 , OSBP , OSBP2 , OSBPL10 , OSBPL11 , OSBPL3 , OSBPL5 , OSBPL6, OSBPL7, OSBPL8 , OSBPL9 ,
- PHLDA2 , PHLDA3, PHLDB1 , PHLDB2 , PHLPP , PIP3-E, PLCD1 , PLCD4 , PLCG1 , PLCG2 , PLCH1, PLCH2, PLCL1, PLCL2, PLD1 , PLD2 , PLEK, PLEK2 , PLEKHA1 , PLEKHA2, PLEKHA3, PLEKHA4, PLEKHA5 , PLEJHA6 , PLEKHA7 , PLEKHA8 , PLEKHB1, PLEKHB2 , PLEKHC1 , PLEKHF1, PLEKHF2 , PLEKHG1 , PLEKHG2, PLEKHG3 , PLEKHG4 , PLEKHG5 , PLEKHG6, PLEKHH1, PLEKHH2, PLEKHH3 , PLEKHJ1, KHK1, PLEKHM1, PLEKHM2, PLEKHO1, PLEKHQ1 , PREX1 , PRKCN , PRKD1 , PRKD2 , PRKD3 , PSCD1 , PSCD2 , PSCD3 , PSCD4 , PSD, PSD2 , PSD3 , PSD4, RALGPS1 , RALGPS2, RAPH1 ,
- RASA1 , RASA2, RASA3 , RASA4 , RASAL1, RASGRF1 , RGNEF, ROCK1 , ROCK2 , RTKN ,
- SBF1 , SBF2 , SCAP2, SGEF , SH2B, SH2B1 , SH2B2 , SH2B3 , SH3BP2 , SKAP1 , SKAP2 , SNTA1 , SNTB1 , SNTB2 , SOS1 , SOS2 , SPATA13 , SPNB4, SPTBN1 , SPTBN2 , SPTBN4 , SPTBN5 , STAP1 , INTERCAMBIO70 , SYNGAP1 ,
- TBC1D2, TEC , TIAM1 , TRIO , TRIOBP , TYL,
- URP1, URP2,
- VAV1 , VAV2 , VAV3 , VEPH1
Ver también
Referencias
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enlaces externos