En biología molecular, el dominio de dedo de zinc FYVE recibe su nombre de las cuatro proteínas ricas en cisteína : F ab 1 (ortólogo de levadura de PIKfyve ), Y OTB, V ac 1 (proteína de transporte de vesículas) y E EA1 , en las que se ha encontrado. Los dominios FYVE se unen al fosfatidilinositol 3-fosfato , [2] de una manera que depende de su coordinación de iones metálicos y aminoácidos básicos. El dominio FYVE se inserta en las membranas celulares de una manera dependiente del pH. [3] El dominio FYVE se ha relacionado con la clasificación de proteínas vacuolares y la función del endosoma . [4]
Estructura
El dominio FYVE está compuesto por dos pequeñas horquillas beta (o nudillos de zinc) seguidas de una hélice alfa . [5] El dedo FYVE une dos iones de zinc . El dedo FYVE tiene ocho posibles posiciones de coordinación de cisteína de zinc y se caracteriza por tener aminoácidos básicos alrededor de las cisteínas. Muchos miembros de esta familia también incluyen dos histidinas en un motivo de secuencia:
R+HHC+XCG , donde + representa un residuo cargado y X cualquier residuo
El dedo FYVE es estructuralmente similar al dominio RING y al dedo PHD .
Ejemplos
La siguiente es una lista de proteínas humanas que contienen este dominio:
- ANKFY1 , EEA1 , FGD1 , FGD2 , FGD3 , FGD4 , FGD5, FGD6, FYCO1, HGS , MTMR3 , MTMR4, PIKFYVE , PLEKHF1, PLEKHF2
- RUFY1 , RUFY2 , RUFY3, RUFY4, WDFY1, WDFY2, WDFY3 , ZFYVE1 , ZFYVE9 , ZFYVE16 , ZFYVE19 , ZFYVE20 , ZFYVE21 , ZFYVE26 , ZFYVE27 , ZFYVE28
Referencias
- ^ Dumas JJ, Merithew E, Sudharshan E, et al. (noviembre de 2001). "Dirección de endosomas multivalentes por EEA1 homodimérico". Mol. Celúla . 8 (5): 947–58. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00385-9 . PMID 11741531.
- ^ Gaullier JM, Simonsen A, D'Arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (julio de 1998). "Los dedos de FYVE unen PtdIns (3) P". Naturaleza . 394 (6692): 432–3. doi :10.1038/28767. PMID 9697764. S2CID 4385768.
- ^ He J, Vora M, Haney RM, et al. (septiembre de 2009). "La inserción en la membrana del dominio FYVE está modulada por el pH". Proteins . 76 (4): 852–60. doi :10.1002/prot.22392. PMC 2909462 . PMID 19296456.
- ^ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (abril de 1999). "Señalización a través de las fosfoinosítido 3-quinasas: los lípidos ocupan un lugar central". Curr. Opin. Cell Biol . 11 (2): 219–25. doi :10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156.
- ^ Misra S, Hurley JH (mayo de 1999). "Estructura cristalina de un motivo de orientación a la membrana específico del fosfatidilinositol 3-fosfato, el dominio FYVE de Vps27p". Cell . 97 (5): 657–66. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80776-X . PMID 10367894. S2CID 15448444.
Lectura adicional
- Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (septiembre de 1996). "La localización endosómica del autoantígeno EEA1 está mediada por un dedo FYVE que se une al zinc". J. Biol. Chem . 271 (39): 24048–54. doi : 10.1074/jbc.271.39.24048 . PMID: 8798641.
- Stenmark H, Aasland R (diciembre de 1999). "Proteínas con dedos FYVE: efectoras de un lípido de inositol". J. Cell Sci . 112 (parte 23): 4175–83. PMID 10564636.