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La carga viral

La carga viral , también conocida como carga viral , es una expresión numérica de la cantidad de virus en un volumen determinado de líquido, incluidas muestras biológicas y ambientales. No debe confundirse con título viral o título viral , que depende del ensayo. Cuando se realiza un ensayo para medir la partícula viral infecciosa (ensayo de placa, ensayo Focus), el título viral a menudo se refiere a la concentración de partículas virales infecciosas, que es diferente de las partículas virales totales . La carga viral se mide utilizando esputo de fluidos corporales [1] y plasma sanguíneo . [2] Como ejemplo de muestras ambientales, la carga viral de norovirus se puede determinar a partir del agua de escorrentía de los productos agrícolas. [3] El norovirus no sólo tiene una diseminación viral prolongada y tiene la capacidad de sobrevivir en el medio ambiente, sino que se requiere una dosis infecciosa minúscula para producir infección en humanos: menos de 100 partículas virales. [4]

La carga viral a menudo se expresa como partículas virales (viriones) o partículas infecciosas por ml, según el tipo de ensayo. Una carga viral, un título o una carga viral más altos a menudo se correlacionan con la gravedad de una infección viral activa . La cantidad de virus por ml se puede calcular estimando la cantidad viva de virus en el líquido involucrado. Por ejemplo, se puede administrar en copias de ARN por mililitro de plasma sanguíneo.

El seguimiento de la carga viral se utiliza para monitorear la terapia durante infecciones virales crónicas y en pacientes inmunocomprometidos, como aquellos que se recuperan de un trasplante de médula ósea o de órganos sólidos . Actualmente, se encuentran disponibles pruebas de rutina para VIH -1, citomegalovirus , virus de la hepatitis B y virus de la hepatitis C. El monitoreo de la carga viral del VIH es de particular interés en el tratamiento de personas con VIH , ya que esto se discute continuamente en el contexto del manejo del VIH/SIDA . Una carga viral indetectable no implica falta de infección. Los pacientes VIH positivos que reciben terapia antirretroviral combinada a largo plazo pueden presentar una carga viral indetectable en la mayoría de los ensayos clínicos, ya que la concentración de partículas virales está por debajo del límite de detección (LOD).

Tecnologías para pruebas de carga viral

Un estudio de revisión de 2010 realizado por Puren et al. [2] clasifica las pruebas de carga viral en tres tipos: (1) pruebas basadas en amplificación de ácido nucleico ( NAT o NAAT) disponibles comercialmente en los Estados Unidos con la aprobación de la Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA), o en el mercado en el Espacio Económico Europeo ( EEE) con el marcado CE ; (2) NAT "caseras" o internas; (3) prueba no basada en ácido nucleico. [ cita necesaria ]

Pruebas basadas en ácidos nucleicos (NAT)

Existen muchos métodos de prueba diferentes de base molecular para cuantificar la carga viral mediante NAT. El material de partida para la amplificación se puede utilizar para dividir estos métodos moleculares en tres grupos: [5]

  1. Amplificación objetivo que utiliza el propio ácido nucleico. Sólo algunos de los métodos más comunes
  2. La amplificación específica de sonda utiliza sondas sintéticas que se unen preferentemente a una secuencia diana. Luego las sondas se amplifican.
  3. La amplificación de señal utiliza grandes cantidades de señal unida a un objetivo no amplificado originalmente presente en la muestra. Un método comúnmente utilizado:
    • El método de ADN ramificado (ADNb) puede utilizar ADN o ARN como ácido nucleico diana. Sondas cortas unidas a un soporte sólido y capturan el ácido nucleico diana. Sondas extensoras adicionales también se unen al ácido nucleico objetivo y a numerosas moléculas indicadoras que se utilizan para aumentar la intensidad de la señal, que se convierte en un recuento viral.

Muestras de plasma

El plasma con EDTA , procedente de una muestra de sangre con EDTA, es una buena fuente de ARN viral libre de células para las pruebas de carga viral basadas en ARN. La extracción de ARN del plasma requiere equipos, reactivos y capacitación especializados, que podrían estar fuera del alcance de laboratorios medianos y pequeños. Se necesita una muestra grande (> 1 ml de plasma) que requiere punción venosa .

Almacenamiento

La sangre con EDTA se puede almacenar a temperatura ambiente durante 30 horas y el plasma separado durante períodos prolongados a -70 °C sin disminuciones significativas en la carga viral.

Medición

La carga viral se informa como copias del ARN del VIH en un mililitro (ml) de sangre. Los cambios en la carga viral generalmente se informan como un cambio logarítmico (en potencias de 10). Por ejemplo, un aumento de tres log en la carga viral (3 log10) es un aumento de 10 3 o 1000 veces el nivel informado anteriormente, mientras que una caída de 500 000 a 500 copias sería una caída de tres log (también 3 log10). [ cita necesaria ]

Otros factores que afectan la carga viral

Diferentes métodos de prueba a menudo dan resultados diferentes para la misma muestra de paciente. Para que sea comparable, se debe utilizar el mismo método de prueba (amplificación del objetivo, amplificación específica de la sonda o amplificación de la señal) cada vez que se analiza una muestra de un paciente. Idealmente, las pruebas a los pacientes deberían realizarse en el mismo laboratorio médico, utilizando la misma prueba de carga viral y analizador.

Ver también

Referencias

  1. ^ Wölfel, romano; Corman, Víctor M.; Guggemos, Wolfgang; Seilmaier, Michael; Zange, Sabine; Müller, Marcel A.; Niemeyer, Daniela; Jones, Terry C.; Vollmar, Patricio; Rothe, Camila ; Hoelscher, Michael; Bleicker, Tobías; Brünink, Sebastián; Schneider, Julia; Ehmann, Rosina; Zwirglmaier, Katrin; Drosten, cristiano; Wendtner, Clemens (2020). "Evaluación virológica de pacientes hospitalizados con COVID-2019". Naturaleza . 581 (7809): 465–469. Código Bib :2020Natur.581..465W. doi : 10.1038/s41586-020-2196-x . PMID  32235945.
  2. ^ ab Puren, Adrián; Gerlach, Jay L.; Weigl, Bernhard H.; Kelso, David M.; Domingo, Gonzalo J. (2010). "Operaciones de laboratorio, procesamiento y manipulación de muestras para pruebas y vigilancia de carga viral". La revista de enfermedades infecciosas . 201 : T27-36. doi : 10.1086/650390 . PMID  20225943.
  3. ^ Shaheen, Mohamed NF; Elmahdy, Elmahdy M.; Chawla-Sarkar, Mamta (2019). "Identificación cuantitativa basada en PCR de virus entéricos que contaminan los productos frescos y el agua superficial utilizada para el riego en Egipto". Investigación en ciencias ambientales y contaminación . 26 (21): 21619–21628. Código Bib : 2019ESPR...2621619S. doi :10.1007/s11356-019-05435-0. PMID  31129895. S2CID  167210903.
  4. ^ Robilotti, Isabel; Deresinski, Stan; Pinsky, Benjamín A. (2015). "Norovirus". Reseñas de microbiología clínica . 28 (1): 134–164. doi :10.1128/CMR.00075-14. PMC 4284304 . PMID  25567225. 
  5. ^ Buckingham, L.; Defectos, ML (2007). Fundamentos, métodos y aplicaciones clínicas del diagnóstico molecular (PDF) . Compañía FA Davis. págs. 121-154. ISBN 978-0-8036-1659-2. Consultado el 7 de septiembre de 2020 .