stringtranslate.com

Proteínas de unión al potenciador de CCAAT

Dominio bZip de C/EBPα unido al ADN. Entrada 1nwq del PDB [1]

Las proteínas de unión al potenciador de CCAAT (o C/EBP ) son una familia de factores de transcripción compuesta por seis miembros, nombrados de C/EBPα a C/EBPζ. Promueven la expresión de ciertos genes a través de la interacción con sus promotores . Una vez unidos al ADN , los C/EBP pueden reclutar los llamados coactivadores (como CBP [2] [3] ) que a su vez pueden abrir la estructura de la cromatina o reclutar factores de transcripción basales .

Función

Las proteínas C/EBP interactúan con el motivo de caja CCAAT ( citosina - citosina- adenosina -adenosina- timidina ), que está presente en varios promotores de genes. Se caracterizan por un dominio de cremallera básica de leucina (bZIP) altamente conservado en el extremo C. Este dominio está involucrado en la dimerización y la unión al ADN, al igual que otros factores de transcripción de la familia que contienen el dominio de cremallera de leucina ( c-Fos y c-jun ). La estructura del dominio bZIP de las C/EBP está compuesta por una hélice α que forma una estructura de "bobina enrollada" cuando se dimeriza. Los miembros de la familia C/EBP pueden formar homodímeros o heterodímeros con otras C/EBP y con otros factores de transcripción, que pueden o no contener el dominio de cremallera de leucina. La dimerización es necesaria para permitir que las C/EBP se unan específicamente al ADN a través de una secuencia palindrómica en el surco mayor del ADN. Las proteínas C/EBP también contienen dominios de activación en el extremo N y dominios reguladores.

Estas proteínas se encuentran en hepatocitos , adipocitos , células hematopoyéticas , bazo , riñón , cerebro y muchos otros órganos. Las proteínas C/EBP están involucradas en diferentes respuestas celulares, como en el control de la proliferación, crecimiento y diferenciación celular, en el metabolismo y en la inmunidad . Casi todos los miembros de la familia C/EBP pueden inducir la transcripción a través de sus dominios de activación al interactuar con componentes del aparato de transcripción basal. (C/EBPγ es una excepción que carece de un dominio de activación transcripcional funcional). Su expresión está regulada en múltiples niveles, incluso a través de hormonas , mitógenos , citocinas , nutrientes y otros factores.

Esta proteína se expresa en el sistema nervioso de los mamíferos y desempeña un papel importante en el desarrollo y la función de las células nerviosas . C/EBPβ desempeña un papel en la diferenciación neuronal, en el aprendizaje, en los procesos de memoria, en las funciones de las células gliales y neuronales y en la expresión del factor neurotrófico .

Transcripción genética

Los genes C/EBPα , C/EBPβ , C/EBPγ y C/EBPδ no tienen intrones . C/EBPζ tiene cuatro exones ; C/EBPε tiene dos, lo que da lugar a cuatro isoformas debido a un uso alternativo de promotores y empalme . Para C/EBPα y C/EBPβ, se pueden producir diferentes tamaños de polipéptidos mediante el uso alternativo de codones de iniciación . Se cree que esto se debe a mecanismos débiles de escaneo de ribosomas . El ARNm de C/EBPα puede transcribirse en dos polipéptidos. Para C/EBPβ, se forman tres polipéptidos diferentes: LAP* (38 kDa), LAP (35 kDa) y LIP (20 kDa). La isoforma más traducida es LAP, luego LAP* y LIP. LIP puede actuar como un inhibidor de los otros C/EBP formando heterodímeros no funcionales.

Regulación

La función de C/EBPβ está regulada por múltiples mecanismos, que incluyen fosforilación , acetilación , activación, autorregulación y represión a través de otros factores de transcripción, elementos oncogénicos o quimiocinas . C/EBPβ puede interactuar con CREB , NF-κB y otras proteínas, lo que genera un potencial de transactivación .

La fosforilación de C/EBPβ puede tener un efecto de activación o de represión. Por ejemplo, la fosforilación de la treonina 235 en C/EBPβ humana, o de la treonina 188 en C/EBPβ de ratón y rata, es importante para la capacidad de transactivación de C/EBPβ . La(s) fosforilación(es) de C/EBPβ en su dominio regulador también puede modular su función.

Se ha demostrado en C. elegans que múltiples elementos cis del ARNm 3'UTR de cebp-1 interactúan con mak-2 para regular positivamente la expresión de CEBP-1 en el desarrollo neuronal. [4]

Importancia clínica

Papel en la adipogénesis

C/EBPβ y δ se inducen transitoriamente durante las primeras etapas de la diferenciación de los adipocitos ( adipogénesis ), mientras que C/EBPα se regula positivamente durante las etapas terminales de la adipogénesis. Estudios in vitro e in vivo han demostrado que cada uno juega un papel importante en este proceso. Por ejemplo, los fibroblastos embrionarios murinos (MEF) de ratones que carecen de C/EBPβ y C/EBPδ muestran una diferenciación de adipocitos deteriorada en respuesta a estímulos adipogénicos. [5] Por el contrario, la expresión ectópica de C/EBPβ y δ en preadipocitos 3T3-L1 promueve la adipogénesis, incluso en ausencia de estímulos adipogénicos. [6] [7] C/EBPβ y δ promueven la adipogénesis, al menos en parte al inducir la expresión de los factores de transcripción adipogénicos "maestros" C/EBPα y PPARγ .

La C/EBPα es necesaria tanto para la adipogénesis como para el funcionamiento normal de los adipocitos. Por ejemplo, los ratones que carecen de C/EBPα en todos los tejidos excepto en el hígado (donde es necesaria para evitar la letalidad posnatal) muestran una formación anormal de tejido adiposo . [8] Además, la expresión ectópica de C/EBPα en varias líneas celulares de fibroblastos promueve la adipogénesis. [9] Es probable que la C/EBPα promueva la adipogénesis al inducir la expresión de PPARγ. [10]

Papel en la osteoporosis

Se ha descubierto que la proteína C/EBPβ tiene un papel en el desarrollo de la osteoporosis . La isoforma completa de la proteína C/EBPβ (LAP) activa el gen MafB , mientras que la isoforma corta (LIP) lo suprime. La activación del gen MafB suprime la formación de osteoclastos . Por lo tanto, la regulación positiva de LAP disminuye el número de osteoclastos y esto debilita el proceso osteoporótico, mientras que la regulación positiva de LIP hace lo contrario, aumentando la pérdida de masa ósea.

El equilibrio LAP/LIP está determinado por la proteína mTOR . La inhibición de la expresión de mTOR puede detener la actividad de los osteoclastos. [11]

Papel en el cáncer

Las proteínas de unión a CCAAT/enhancer suelen estar implicadas en la detención del crecimiento y la diferenciación, lo que se ha interpretado como una sugerencia de que estas proteínas albergan actividades supresoras de tumores. Sin embargo, la sobreexpresión de la proteína de unión a CCAAT/enhancer se correlaciona con un mal pronóstico en el glioblastoma y promueve la inestabilidad genómica en el cáncer de cuello uterino, lo que sugiere un papel oncogénico. Sin embargo, es importante destacar que C/EBPδ actúa como un supresor tumoral en el adenocarcinoma ductal pancreático. Esto es de particular interés ya que solo se han identificado unos pocos supresores tumorales en el contexto del cáncer de páncreas. [12] La función de las proteínas de unión a CCAAT/enhancer en el cáncer depende claramente del contexto, pero es en gran medida supresora tumoral.

Papel en la neurodegeneración

Los niveles de C/EBPβ aumentan en muestras corticales de víctimas de la enfermedad de Alzheimer y Parkinson en la autopsia. [13] Los estudios de cultivo celular en ratones y líneas de microglia humana también encuentran una mayor actividad de C/EBPβ asociada con la inflamación patógena y las respuestas de citocinas. El análisis posterior de los genes regulados por C/EBPβ tiene importancia en la respuesta inmunitaria, la salud mitocondrial y la autofagia . Se ha demostrado que la interferencia molecular de estos procesos celulares desempeña un papel en la patogénesis neurodegenerativa. [14] Las vías genéticas y moleculares con implicaciones degenerativas que involucran a C/EBPβ y sus homólogos se conservan en múltiples organismos modelo, incluidos Mus musculus, Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans y Danio rerio . [14] [15] Los reguladores ascendentes de C/EBPβ incluyen genes que se sabe que están asociados con enfermedades neurodegenerativas y del neurodesarrollo cuando mutan o se desregulan. Esto incluye una vía de respuesta al estrés celular bien caracterizada que involucra a p38 y JNK. [16]

Referencias

  1. ^ Miller M, Shuman JD, Sebastian T, Dauter Z, Johnson PF (abril de 2003). "Base estructural para el reconocimiento de ADN por el factor de transcripción de cremallera de leucina de la región básica CCAAT/proteína de unión al potenciador alfa". The Journal of Biological Chemistry . 278 (17): 15178–84. doi : 10.1074/jbc.M300417200 . PMID  12578822.
  2. ^ Kovács KA, Steinmann M, Magistretti PJ, Halfon O, Cardinaux JR (septiembre de 2003). "Los miembros de la familia de proteínas de unión a potenciadores/CCAAT reclutan la proteína de unión a CREB coactivadora y desencadenan su fosforilación". The Journal of Biological Chemistry . 278 (38): 36959–65. doi : 10.1074/jbc.M303147200 . PMID  12857754.
  3. ^ Ramji DP, Foka P (agosto de 2002). "Proteínas de unión a CCAAT/enhancer: estructura, función y regulación". The Biochemical Journal . 365 (Pt 3): 561–75. doi :10.1042/BJ20020508. PMC 1222736 . PMID  12006103. 
  4. ^ Sharifnia P, Kim KW, Wu Z, Jin Y (septiembre de 2017). "Distintos elementos cis en el 3' UTR del ARNm de cebp-1 de C. elegans median su regulación en el desarrollo neuronal". Biología del desarrollo . 429 (1): 240–248. doi :10.1016/j.ydbio.2017.06.022. PMC 5828015 . PMID  28673818. 
  5. ^ Tanaka T, Yoshida N, Kishimoto T, Akira S (diciembre de 1997). "Diferenciación defectuosa de adipocitos en ratones que carecen del gen C/EBPbeta y/o C/EBPdelta". The EMBO Journal . 16 (24): 7432–43. doi :10.1093/emboj/16.24.7432. PMC 1170343 . PMID  9405372. 
  6. ^ Cao Z, Umek RM, McKnight SL (septiembre de 1991). "Expresión regulada de tres isoformas C/EBP durante la conversión adiposa de células 3T3-L1". Genes & Development . 5 (9): 1538–52. doi : 10.1101/gad.5.9.1538 . PMID  1840554.
  7. ^ Yeh WC, Cao Z, Classon M, McKnight SL (enero de 1995). "Regulación en cascada de la diferenciación terminal de adipocitos por tres miembros de la familia C/EBP de proteínas con cremallera de leucina". Genes & Development . 9 (2): 168–81. doi : 10.1101/gad.9.2.168 . PMID  7531665.
  8. ^ Linhart HG, Ishimura-Oka K, DeMayo F, Kibe T, Repka D, Poindexter B, Bick RJ, Darlington GJ (octubre de 2001). "C/EBPalpha es necesaria para la diferenciación del tejido adiposo blanco, pero no del marrón". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 98 (22): 12532–7. Bibcode :2001PNAS...9812532L. doi : 10.1073/pnas.211416898 . PMC 60088 . PMID  11606718. 
  9. ^ Freytag SO, Paielli DL, Gilbert JD (julio de 1994). "La expresión ectópica de la proteína de unión a CCAAT/enhancer alpha promueve el programa adipogénico en una variedad de células fibroblásticas de ratón". Genes & Development . 8 (14): 1654–63. doi : 10.1101/gad.8.14.1654 . PMID  7958846.
  10. ^ Clarke SL, Robinson CE, Gimble JM (noviembre de 1997). "Las proteínas de unión CAAT/enhancer modulan directamente la transcripción a partir del promotor del receptor gamma 2 activado por el proliferador de peroxisomas". Biochemical and Biophysical Research Communications . 240 (1): 99–103. doi :10.1006/bbrc.1997.7627. PMID  9367890.
  11. ^ [1] La oxitocina controla la diferenciación de las células madre mesenquimales humanas y revierte la osteoporosis
  12. ^ Hartl L, Duitman J, Aberson HL, Chen K, Dijk F, Roelofs JJ, Dings MP, Hooijer GK, Hernanda PY, Pan Q, Busch OR, Besselink MG, Boerman T, Peppelenbosch MP, Bijlsma MF, Spek CA (septiembre de 2020). "CCAAT/proteína de unión al potenciador delta (C/EBPδ): un supresor tumoral previamente no reconocido que limita el potencial oncogénico de las células del adenocarcinoma ductal pancreático". Cancers (Basel) . 12 (9): 2546. doi : 10.3390/cancers12092546 . PMC 7564797. PMID  32906832 . 
  13. ^ Strohmeyer, Ron; Shelton, Jadd; Lougheed, Christopher; Breitkopf, Trisia (22 de enero de 2014). Gao, Hongwei (ed.). "Expresión y elevación de la proteína de unión al potenciador CCAAT-β en la enfermedad de Alzheimer y en cultivos de células microgliales". PLOS ONE . ​​9 (1): e86617. Bibcode :2014PLoSO...986617S. doi : 10.1371/journal.pone.0086617 . ISSN  1932-6203. PMC 3899300 . PMID  24466171. 
  14. ^ ab Ding, Chen; Wu, Youjun; Dabas, Hadas; Hammarlund, Marc (14 de marzo de 2022). "La activación de la vía de la quinasa MAP CaMKII-Sarm1-ASK1-p38 protege contra la degeneración axonal causada por la pérdida de mitocondrias". eLife . 11 : e73557. doi : 10.7554/eLife.73557 . ISSN  2050-084X. PMC 8920508 . PMID  35285800. 
  15. ^ Po, Michelle D; Hwang, Christine; Zhen, Mei (febrero de 2010). "PHR: uniendo la guía axonal, el crecimiento y el desarrollo de la sinapsis". Current Opinion in Neurobiology . 20 (1): 100–107. doi :10.1016/j.conb.2009.12.007. PMID  20079626.
  16. ^ Falcicchia, Chiara; Tozzi, Francesca; Arancio, Ottavio; Watterson, Daniel Martin; Origlia, Nicola (6 de agosto de 2020). "Participación de p38 MAPK en la función y disfunción sináptica". Revista internacional de ciencias moleculares . 21 (16): 5624. doi : 10.3390/ijms21165624 . ISSN  1422-0067. PMC 7460549 . PMID  32781522. 

Enlaces externos