Shankar creció en Jaffna, Ceilán, donde aprendió música carnática y otros estilos tradicionales, desde muy joven.
Tras los graves disturbios étnicos de Sri Lanka en los años 1950, su familia volvió a la India.
Durante los años 1980, Shankar grabó periódicamente como líder, haciendo tanto jazz fusión, como música clásica india.
[3] Shankar trabajó en la banda sonora de la película La última tentación de Cristo (1988), compuesta por Peter Gabriel; música que se publicó en dos discos, Passion: Music for The Last Temptation of Christ y Passion - Sources.
[3][5] Recientemente, Shankar comenzó a usar otro nombre, Shenkar, y ha realizado grabaciones bajo este seudónimo.