En el cine, ha interpretado a Izabella en Transformers: el último caballero (2017), Lizzy en Instant Family (2018), Isabel en Sicario: Day of the Soldado (2018), el personaje principal en Dora and the Lost City of Gold (2019), Rachel Cooper en la película de Netflix Sweet Girl (2021), a Kay en Alien: Romulus (2024) y a Chica Halcón en Superman (2025).Lanzó un álbum producido por Broadway Records en septiembre de 2015, titulado Stopping Time.En el 2022 saco su sencillo “Agonía” junto a Kayfex, rodada en la ciudad de Ayacucho, el tema es inspirado en el cuento “La Agonía de Rasu Ñiti”, con el que Isabela rindió un tributo a sus raíces peruanas.[15] Prestó su voz a Heather en la película animada The Nut Job 2: Nutty by Nature (2017).Merced fue elegida junto a Jason Momoa y Manuel García Rulfo como la protagonista en la película Sweet Girl (2021) de Netflix.[21] Merced fue elegida para protagonizar una nueva película para HBO Turtles All the Way Down (2024) del reconocido escritor estadounidense John Michael Green.